Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C8

UFC1, Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFC1Q9Y3C8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFC1Q9Y3C8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFC1Q9Y3C8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFC1Q9Y3C8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFC1Q9Y3C8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFC1Q9Y3C8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFC1Q9Y3C8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFC1Q9Y3C8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFC1Q9Y3C8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFC1Q9Y3C8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFC1Q9Y3C8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFC1Q9Y3C8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFC1Q9Y3C8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFC1Q9Y3C8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFC1Q9Y3C8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFC1Q9Y3C8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFC1Q9Y3C8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFC1Q9Y3C8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFC1Q9Y3C8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFC1Q9Y3C8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFC1Q9Y3C8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UFC1Q9Y3C8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFC1Q9Y3C8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFC1Q9Y3C8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFC1Q9Y3C8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFC1Q9Y3C8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFC1Q9Y3C8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFC1Q9Y3C8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms