Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5P1

ZC3H8, Zinc finger CCCH domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 35.33□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 55.29□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.26□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 50.1
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.293e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt14.22□□□□□ -0.133e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 29.52□□□□□ -0.893e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 59.25□□□□□ -0.933e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 58.48□□□□□ -1.053e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.12□□□□□ -1.433e-14■■■■■ 49.8
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ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 56.45□□□□□ -1.382e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.14□□□□□ -1.596e-13■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.85□□□□□ -1.636e-13■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.02□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.02□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.886e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.2□□□□□ -0.946e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.58□□□□□ -1.046e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.56□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 27.36□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.17□□□□□ -1.266e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.466e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.254e-23■■■■■ 45.4
ZC3H8Q8N5P1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-18■■■■■ 45.1
ZC3H8Q8N5P1 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.03□□□□□ -1.61e-18■■■■■ 45.1
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 313.69□□□□□ -0.222e-17■■■■■ 45
ZC3H8Q8N5P1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.862e-17■■■■■ 45
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ZC3H8Q8N5P1 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.16□□□□□ -1.586e-9■■■■■ 44.7
ZC3H8Q8N5P1 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.983e-12■■■■■ 44.5
ZC3H8Q8N5P1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC10.37□□□□□ -0.751e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.09□□□□□ -1.591e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-221ENST00000521334 909 ntTSL 319.41■□□□□ 0.72e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-225ENST00000522837 558 ntTSL 412.49□□□□□ -0.412e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 412.4□□□□□ -0.422e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 312.07□□□□□ -0.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.552e-36■■■■■ 43.7
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ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 411.31□□□□□ -0.62e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-36■■■■■ 43.7
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ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.692e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-212ENST00000518871 484 ntTSL 410.39□□□□□ -0.752e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.812e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-36■■■■■ 43.7
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ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-209ENST00000518649 555 ntTSL 46.08□□□□□ -1.442e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-220ENST00000521081 622 ntTSL 25.83□□□□□ -1.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.482e-36■■■■■ 43.7
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ZC3H8Q8N5P1 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 28.9□□□□□ -0.982e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.02□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.11□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.6□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.882e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.312e-31■■■■■ 42.5
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 42
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 414.25□□□□□ -0.132e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.18□□□□□ -1.92e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.962e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 35.67□□□□□ -1.53e-12■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.521e-6■■■■■ 39.1
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 518.44■□□□□ 0.549e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.06■□□□□ 0.329e-9■■■■■ 38.6
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