Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5P1

ZC3H8, Zinc finger CCCH domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 35.33□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 55.29□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.26□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 50.3
ZC3H8Q8N5P1 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 50.1
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.293e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt14.22□□□□□ -0.133e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 29.52□□□□□ -0.893e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 59.25□□□□□ -0.933e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 58.48□□□□□ -1.053e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.12□□□□□ -1.433e-14■■■■■ 49.8
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 56.45□□□□□ -1.382e-23■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.14□□□□□ -1.596e-13■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.85□□□□□ -1.636e-13■■■■■ 48.3
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.02□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.02□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.886e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.2□□□□□ -0.946e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.58□□□□□ -1.046e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.56□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 27.36□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.17□□□□□ -1.266e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.466e-10■■■■■ 46.8
ZC3H8Q8N5P1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.254e-23■■■■■ 45.4
ZC3H8Q8N5P1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-18■■■■■ 45.1
ZC3H8Q8N5P1 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.03□□□□□ -1.61e-18■■■■■ 45.1
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ZC3H8Q8N5P1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.862e-17■■■■■ 45
ZC3H8Q8N5P1 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.54e-22■■■■■ 44.9
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ZC3H8Q8N5P1 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 214.46□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 44.7
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 511.5□□□□□ -0.576e-9■■■■■ 44.7
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.15□□□□□ -0.626e-9■■■■■ 44.7
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.16□□□□□ -1.586e-9■■■■■ 44.7
ZC3H8Q8N5P1 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.983e-12■■■■■ 44.5
ZC3H8Q8N5P1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC10.37□□□□□ -0.751e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.09□□□□□ -1.591e-15■■■■■ 43.9
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-221ENST00000521334 909 ntTSL 319.41■□□□□ 0.72e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-225ENST00000522837 558 ntTSL 412.49□□□□□ -0.412e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 412.4□□□□□ -0.422e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 312.07□□□□□ -0.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.552e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.552e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 411.31□□□□□ -0.62e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 511.08□□□□□ -0.632e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.692e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-212ENST00000518871 484 ntTSL 410.39□□□□□ -0.752e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.812e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-209ENST00000518649 555 ntTSL 46.08□□□□□ -1.442e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 C14orf159-220ENST00000521081 622 ntTSL 25.83□□□□□ -1.482e-36■■■■■ 43.7
ZC3H8Q8N5P1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.482e-36■■■■■ 43.7
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ZC3H8Q8N5P1 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 28.9□□□□□ -0.982e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.02□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.11□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.6□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.882e-10■■■■■ 42.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.312e-31■■■■■ 42.5
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 42
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 414.25□□□□□ -0.132e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.18□□□□□ -1.92e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.962e-17■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 35.67□□□□□ -1.53e-12■■■■■ 39.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.521e-6■■■■■ 39.1
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 518.44■□□□□ 0.549e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.06■□□□□ 0.329e-9■■■■■ 38.6
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