Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 75.7
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DHX30Q7L2E3 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.3■■□□□ 1.89e-9■■■■■ 74.9
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.47e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 215.56■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.537e-9■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.657e-9■■■■■ 74
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DHX30Q7L2E3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 72.9
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DHX30Q7L2E3 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 72.7
DHX30Q7L2E3 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.29■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.51□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.943e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 MELTF-205ENST00000473501 2757 ntTSL 222.2■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 71.4
DHX30Q7L2E3 RNF166-204ENST00000562499 590 ntTSL 410.46□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 71.4
DHX30Q7L2E3 AL512328.1-201ENST00000412344 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-22■■■■■ 71.1
DHX30Q7L2E3 AKAP6-202ENST00000553547 2274 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 70.4
DHX30Q7L2E3 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 70.4
DHX30Q7L2E3 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 70.4
DHX30Q7L2E3 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.621e-9■■■■■ 70.4
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DHX30Q7L2E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.232e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 320.06■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.981e-323■■■■■ 67.8
DHX30Q7L2E3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 67.1
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DHX30Q7L2E3 CPA6-203ENST00000518549 1538 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 67.1
DHX30Q7L2E3 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 67.1
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DHX30Q7L2E3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 64.9
DHX30Q7L2E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.822e-8■■■■■ 64.9
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DHX30Q7L2E3 PRKAB1-207ENST00000542698 4019 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 64.9
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DHX30Q7L2E3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 64.3
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DHX30Q7L2E3 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 216.92■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 64.3
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DHX30Q7L2E3 AC114488.2-213ENST00000585413 845 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-10■■■■■ 62.5
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DHX30Q7L2E3 AC114488.2-217ENST00000593188 676 ntTSL 516.96■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-209ENST00000608246 686 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-203ENST00000609625 760 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-216ENST00000624388 610 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-204ENST00000609549 829 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-201ENST00000623791 695 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-202ENST00000610043 900 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 62.5
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DHX30Q7L2E3 AC114488.2-211ENST00000610216 695 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 61.7
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 61.7
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