Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 75.7
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DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.47e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 215.56■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 74
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DHX30Q7L2E3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.537e-9■■■■■ 74
DHX30Q7L2E3 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.657e-9■■■■■ 74
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DHX30Q7L2E3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 72.9
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DHX30Q7L2E3 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.29■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 72.2
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DHX30Q7L2E3 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 72.2
DHX30Q7L2E3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.943e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 RNF166-206ENST00000564894 574 ntTSL 414.74□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 71.4
DHX30Q7L2E3 MTRNR2L1-201ENST00000540040 1553 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 71.4
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DHX30Q7L2E3 RNF166-204ENST00000562499 590 ntTSL 410.46□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 71.4
DHX30Q7L2E3 AL512328.1-201ENST00000412344 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-22■■■■■ 71.1
DHX30Q7L2E3 AKAP6-202ENST00000553547 2274 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 70.4
DHX30Q7L2E3 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 70.4
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DHX30Q7L2E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.232e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 320.06■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 69.6
DHX30Q7L2E3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.981e-323■■■■■ 67.8
DHX30Q7L2E3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 67.1
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DHX30Q7L2E3 CPA6-203ENST00000518549 1538 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 67.1
DHX30Q7L2E3 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 67.1
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DHX30Q7L2E3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 64.9
DHX30Q7L2E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.822e-8■■■■■ 64.9
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DHX30Q7L2E3 PRKAB1-207ENST00000542698 4019 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 64.9
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DHX30Q7L2E3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 64.3
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DHX30Q7L2E3 AC114488.2-217ENST00000593188 676 ntTSL 516.96■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-209ENST00000608246 686 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-203ENST00000609625 760 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-216ENST00000624388 610 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-204ENST00000609549 829 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-201ENST00000623791 695 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 62.5
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DHX30Q7L2E3 AC114488.2-211ENST00000610216 695 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 62.5
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 61.7
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 61.7
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