Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 33.6
G3BP1Q13283 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 323.4■■□□□ 1.343e-14■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 323.01■■□□□ 1.273e-14■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-17■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 523.4■■□□□ 1.343e-14■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 ALDH1A1-204ENST00000446946 805 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 33.2
G3BP1Q13283 MRPL17-202ENST00000529958 1002 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.31e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 AP1B1-206ENST00000415756 519 ntTSL 316.64■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 MRPL17-203ENST00000532203 448 ntTSL 316.26■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 AP1B1-207ENST00000421126 1908 ntTSL 515.07■□□□□ 01e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-204ENST00000513112 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-206ENST00000522203 653 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 RARS-205ENST00000520421 396 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-203ENST00000508754 793 ntTSL 26.38□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-205ENST00000519064 684 ntTSL 24.57□□□□□ -1.681e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 IKBKB-228ENST00000523517 2378 ntTSL 1 (best)21.45■■□□□ 1.021e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-205ENST00000517812 523 ntTSL 320.5■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-206ENST00000517890 2501 ntTSL 219.9■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-207ENST00000517917 1731 ntTSL 217.88■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-209ENST00000518679 2784 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-211ENST00000519733 527 ntTSL 417.46■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-203ENST00000517388 577 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-208ENST00000518647 1543 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-227ENST00000523105 1966 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-214ENST00000520201 5002 ntTSL 215.24■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-215ENST00000520320 628 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-201ENST00000342222 3952 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-220ENST00000521661 2196 ntTSL 514.4□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-216ENST00000520655 3777 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 KLC4-213ENST00000472172 753 ntTSL 213.89□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 317.2■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 CMTR1-205ENST00000475364 1032 ntTSL 522.84■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 NGDN-203ENST00000553336 712 ntTSL 320.86■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 316.59■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 CTNNBL1-205ENST00000447935 778 ntTSL 523.67■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 ACACA-229ENST00000613776 1372 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 SRRT-211ENST00000478693 655 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 SRRT-208ENST00000469602 376 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 528.48■■■□□ 2.156e-12■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 311.35□□□□□ -0.595e-9■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 49.39□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 VARS-223ENST00000474643 885 ntTSL 518.66■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 31.6
G3BP1Q13283 PLK1-206ENST00000564947 553 ntTSL 314.15□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 31.4
G3BP1Q13283 EIF4A3-204ENST00000575668 831 ntTSL 213.01□□□□□ -0.335e-10■■■■■ 31.4
G3BP1Q13283 ELAC2-213ENST00000578104 664 ntTSL 319.51■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 513.01□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 411.31□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 LRRC47-202ENST00000462356 575 ntTSL 216.55■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 31.2
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G3BP1Q13283 LRRC47-203ENST00000479239 434 ntTSL 37.54□□□□□ -1.24e-9■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 222.85■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 318.48■□□□□ 0.557e-8■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 229.38■■■□□ 2.293e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 57.54□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-207ENST00000558539 595 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 24.93□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC11.02□□□□□ -0.653e-31■■■■■ 30.9
G3BP1Q13283 LMNB1-207ENST00000494185 579 ntTSL 22.61□□□□□ -1.993e-7■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 523.51■■□□□ 1.352e-14■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-14■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 37.78□□□□□ -1.162e-14■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ALDH1A1-205ENST00000482210 879 ntTSL 26.78□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 30.5
G3BP1Q13283 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-204ENST00000446899 858 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-206ENST00000476042 428 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-214ENST00000578991 550 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 KIF22-205ENST00000563666 1603 ntTSL 520.43■□□□□ 0.868e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 519.89■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 SUPT6H-211ENST00000584312 483 ntTSL 25.93□□□□□ -1.468e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-206ENST00000468119 619 ntTSL 413.4□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 EPHA2-202ENST00000461614 875 ntTSL 230.92■■■□□ 2.542e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 SRP68-209ENST00000590833 582 ntTSL 28.24□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 ALDH1A1-206ENST00000493113 604 ntTSL 27.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 PRMT5-209ENST00000553502 414 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 515.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 XRCC6-208ENST00000478914 550 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-208ENST00000590416 699 ntTSL 220.88■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-204ENST00000585887 445 ntTSL 220.55■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 212.01□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 29.9
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