Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 33.6
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G3BP1Q13283 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 323.01■■□□□ 1.273e-14■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-17■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 523.4■■□□□ 1.343e-14■■■■■ 33.3
G3BP1Q13283 ALDH1A1-204ENST00000446946 805 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 33.2
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G3BP1Q13283 AP1B1-207ENST00000421126 1908 ntTSL 515.07■□□□□ 01e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-204ENST00000513112 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 33.1
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G3BP1Q13283 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 33.1
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G3BP1Q13283 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-203ENST00000508754 793 ntTSL 26.38□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 YIPF5-205ENST00000519064 684 ntTSL 24.57□□□□□ -1.681e-9■■■■■ 33.1
G3BP1Q13283 IKBKB-228ENST00000523517 2378 ntTSL 1 (best)21.45■■□□□ 1.021e-8■■■■■ 32.6
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G3BP1Q13283 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-203ENST00000517388 577 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-208ENST00000518647 1543 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-227ENST00000523105 1966 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 32.6
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G3BP1Q13283 IKBKB-215ENST00000520320 628 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-201ENST00000342222 3952 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 32.6
G3BP1Q13283 IKBKB-220ENST00000521661 2196 ntTSL 514.4□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 32.6
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G3BP1Q13283 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 317.2■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 32.2
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G3BP1Q13283 NGDN-203ENST00000553336 712 ntTSL 320.86■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 316.59■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 32.2
G3BP1Q13283 CTNNBL1-205ENST00000447935 778 ntTSL 523.67■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 31.9
G3BP1Q13283 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 31.9
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G3BP1Q13283 SRRT-208ENST00000469602 376 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 31.7
G3BP1Q13283 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 528.48■■■□□ 2.156e-12■■■■■ 31.7
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G3BP1Q13283 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 49.39□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 31.7
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G3BP1Q13283 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 31.3
G3BP1Q13283 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 513.01□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 31.3
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G3BP1Q13283 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 222.85■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 318.48■□□□□ 0.557e-8■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 229.38■■■□□ 2.293e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 57.54□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-207ENST00000558539 595 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 31.2
G3BP1Q13283 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 24.93□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 31.2
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G3BP1Q13283 LMNB1-207ENST00000494185 579 ntTSL 22.61□□□□□ -1.993e-7■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 523.51■■□□□ 1.352e-14■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-14■■■■■ 30.8
G3BP1Q13283 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 37.78□□□□□ -1.162e-14■■■■■ 30.8
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G3BP1Q13283 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-204ENST00000446899 858 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-206ENST00000476042 428 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 ELAC2-214ENST00000578991 550 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 30.4
G3BP1Q13283 KIF22-205ENST00000563666 1603 ntTSL 520.43■□□□□ 0.868e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 519.89■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 SUPT6H-211ENST00000584312 483 ntTSL 25.93□□□□□ -1.468e-9■■■■■ 30.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-206ENST00000468119 619 ntTSL 413.4□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 EPHA2-202ENST00000461614 875 ntTSL 230.92■■■□□ 2.542e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 30.2
G3BP1Q13283 SRP68-209ENST00000590833 582 ntTSL 28.24□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 ALDH1A1-206ENST00000493113 604 ntTSL 27.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 PRMT5-209ENST00000553502 414 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 515.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 30.1
G3BP1Q13283 XRCC6-208ENST00000478914 550 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-208ENST00000590416 699 ntTSL 220.88■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-204ENST00000585887 445 ntTSL 220.55■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 29.9
G3BP1Q13283 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 212.01□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 29.9
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