Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 SSA4YER103W 1929 nt13.59□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 YLR236CYLR236C 324 nt13.59□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.58□□□□□ -0.24
RTP1Q12751 CCT6YDR188W 1641 nt13.54□□□□□ -0.24
RTP1Q12751 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.42□□□□□ -0.26
RTP1Q12751 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.42□□□□□ -0.26
RTP1Q12751 ADO1YJR105W 1023 nt13.42□□□□□ -0.26
RTP1Q12751 ALF1YNL148C 765 nt13.37□□□□□ -0.27
RTP1Q12751 YJL152WYJL152W 360 nt13.34□□□□□ -0.27
RTP1Q12751 LPX1YOR084W 1164 nt13.34□□□□□ -0.27
RTP1Q12751 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.33□□□□□ -0.28
RTP1Q12751 YEL076CYEL076C 651 nt13.33□□□□□ -0.28
RTP1Q12751 ERV46YAL042W 1248 nt13.33□□□□□ -0.28
RTP1Q12751 YLR464WYLR464W 651 nt13.33□□□□□ -0.28
RTP1Q12751 IDH1YNL037C 1083 nt13.29□□□□□ -0.28
RTP1Q12751 SPP1YPL138C 1062 nt13.26□□□□□ -0.29
RTP1Q12751 UBX6YJL048C 1191 nt13.24□□□□□ -0.29
RTP1Q12751 RTG1YOL067C 534 nt13.22□□□□□ -0.29
RTP1Q12751 BDF1YLR399C 2061 nt13.21□□□□□ -0.29
RTP1Q12751 YDR433WYDR433W 441 nt13.2□□□□□ -0.3
RTP1Q12751 SIS1YNL007C 1059 nt13.2□□□□□ -0.3
RTP1Q12751 YKR040CYKR040C 504 nt13.18□□□□□ -0.3
RTP1Q12751 YDR095CYDR095C 411 nt13.17□□□□□ -0.3
RTP1Q12751 YPS1YLR120C 1710 nt13.16□□□□□ -0.3
RTP1Q12751 GBP2YCL011C 1284 nt13.09□□□□□ -0.31
RTP1Q12751 TIR4YOR009W 1464 nt13.06□□□□□ -0.32
RTP1Q12751 HUA1YGR268C 597 nt13.02□□□□□ -0.33
RTP1Q12751 MXR2YCL033C 507 nt13.02□□□□□ -0.33
RTP1Q12751 MEP2YNL142W 1500 nt13.02□□□□□ -0.33
RTP1Q12751 TAT1YBR069C 1860 nt13.02□□□□□ -0.33
RTP1Q12751 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13□□□□□ -0.33
RTP1Q12751 YDR094WYDR094W 336 nt12.95□□□□□ -0.34
RTP1Q12751 CAC2YML102W 1407 nt12.95□□□□□ -0.34
RTP1Q12751 RPP2AYOL039W 321 nt12.93□□□□□ -0.34
RTP1Q12751 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.9□□□□□ -0.34
RTP1Q12751 TCD2YKL027W 1344 nt12.88□□□□□ -0.35
RTP1Q12751 PET9YBL030C 957 nt12.87□□□□□ -0.35
RTP1Q12751 YMR057CYMR057C 372 nt12.86□□□□□ -0.35
RTP1Q12751 ART5YGR068C 1761 nt12.86□□□□□ -0.35
RTP1Q12751 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.82□□□□□ -0.36
RTP1Q12751 PTP1YDL230W 1008 nt12.79□□□□□ -0.36
RTP1Q12751 DCW1YKL046C 1350 nt12.78□□□□□ -0.36
RTP1Q12751 FRD1YEL047C 1413 nt12.76□□□□□ -0.37
RTP1Q12751 GFD2YCL036W 1701 nt12.75□□□□□ -0.37
RTP1Q12751 DED1YOR204W 1815 nt12.71□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 YKL030WYKL030W 606 nt12.69□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 PTH1YHR189W 573 nt12.67□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 YLR235CYLR235C 399 nt12.67□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 RRD1YIL153W 1182 nt12.66□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 YCL042WYCL042W 360 nt12.66□□□□□ -0.38
RTP1Q12751 YBR220CYBR220C 1683 nt12.64□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 PAC11YDR488C 1602 nt12.64□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 FPS1YLL043W 2010 nt12.6□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 EMI2YDR516C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 SOR2YDL246C 1074 nt12.59□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 SOR1YJR159W 1074 nt12.59□□□□□ -0.39
RTP1Q12751 LCB1YMR296C 1677 nt12.56□□□□□ -0.4
RTP1Q12751 FMT1YBL013W 1206 nt12.55□□□□□ -0.4
RTP1Q12751 YMR090WYMR090W 684 nt12.52□□□□□ -0.41
RTP1Q12751 RTS2YOR077W 699 nt12.52□□□□□ -0.41
RTP1Q12751 PAU16YKL224C 372 nt12.46□□□□□ -0.41
RTP1Q12751 SDH1YKL148C 1923 nt12.45□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 FMP52YER004W 696 nt12.45□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 YDL221WYDL221W 552 nt12.44□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 YFR018CYFR018C 1092 nt12.44□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 SBA1YKL117W 651 nt12.44□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 CUE1YMR264W 612 nt12.44□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 RRT5YFR032C 870 nt12.41□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.41□□□□□ -0.42
RTP1Q12751 CWP1YKL096W 720 nt12.39□□□□□ -0.43
RTP1Q12751 IRC15YPL017C 1500 nt12.38□□□□□ -0.43
RTP1Q12751 TIM23YNR017W 669 nt12.37□□□□□ -0.43
RTP1Q12751 PCH2YBR186W 1695 nt12.35□□□□□ -0.43
RTP1Q12751 NVJ2YPR091C 2313 nt12.34□□□□□ -0.43
RTP1Q12751 ADH2YMR303C 1047 nt12.33□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 GUT2YIL155C 1950 nt12.32□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 YIL100WYIL100W 354 nt12.3□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 DIC1YLR348C 897 nt12.3□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 PRE6YOL038W 765 nt12.3□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 SEC11YIR022W 504 nt12.29□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 GIS3YLR094C 1509 nt12.28□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 YLR179CYLR179C 606 nt12.28□□□□□ -0.44
RTP1Q12751 YPR064WYPR064W 420 nt12.27□□□□□ -0.45
RTP1Q12751 SCC4YER147C 1875 nt12.24□□□□□ -0.45
RTP1Q12751 SNF6YHL025W 999 nt12.21□□□□□ -0.45
RTP1Q12751 TAD3YLR316C 969 nt12.21□□□□□ -0.45
RTP1Q12751 PCM1YEL058W 1674 nt12.19□□□□□ -0.46
RTP1Q12751 PIB2YGL023C 1908 nt12.18□□□□□ -0.46
RTP1Q12751 YJL225CYJL225C 5277 nt12.17□□□□□ -0.46
RTP1Q12751 RNQ1YCL028W 1218 nt12.16□□□□□ -0.46
RTP1Q12751 AHT1YHR093W 549 nt12.14□□□□□ -0.47
RTP1Q12751 WSC2YNL283C 1512 nt12.13□□□□□ -0.47
RTP1Q12751 YIH1YCR059C 777 nt12.12□□□□□ -0.47
RTP1Q12751 NAT4YMR069W 858 nt12.09□□□□□ -0.47
RTP1Q12751 YFL066CYFL066C 1179 nt12.08□□□□□ -0.48
RTP1Q12751 PEX25YPL112C 1185 nt12.08□□□□□ -0.48
RTP1Q12751 YSC84YHR016C 1407 nt12.03□□□□□ -0.48
RTP1Q12751 AQY1YPR192W 918 nt12.01□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 GLK1YCL040W 1503 nt12□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 YHL050CYHL050C 2094 nt11.99□□□□□ -0.49
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