Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 IRC15YPL017C 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
SPE4Q12455 ART5YGR068C 1761 nt12.39□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 SCC4YER147C 1875 nt12.39□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 GFD2YCL036W 1701 nt12.38□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 GIS3YLR094C 1509 nt12.35□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 YKL097CYKL097C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 RKM5YLR137W 1104 nt12.34□□□□□ -0.43
SPE4Q12455 Q0182Q0182 405 nt12.3□□□□□ -0.44
SPE4Q12455 RTS2YOR077W 699 nt12.3□□□□□ -0.44
SPE4Q12455 PET9YBL030C 957 nt12.29□□□□□ -0.44
SPE4Q12455 TIR4YOR009W 1464 nt12.24□□□□□ -0.45
SPE4Q12455 YCH1YGR203W 447 nt12.22□□□□□ -0.45
SPE4Q12455 SEC11YIR022W 504 nt12.19□□□□□ -0.46
SPE4Q12455 PCH2YBR186W 1695 nt12.18□□□□□ -0.46
SPE4Q12455 CUE1YMR264W 612 nt12.16□□□□□ -0.46
SPE4Q12455 YMR057CYMR057C 372 nt12.15□□□□□ -0.46
SPE4Q12455 YSC84YHR016C 1407 nt12.14□□□□□ -0.47
SPE4Q12455 GUT2YIL155C 1950 nt12.12□□□□□ -0.47
SPE4Q12455 NPL3YDR432W 1245 nt12.09□□□□□ -0.47
SPE4Q12455 YOL037CYOL037C 354 nt12.06□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 YHL050CYHL050C 2094 nt12.06□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 YJL152WYJL152W 360 nt12.05□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.04□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 FPS1YLL043W 2010 nt12.03□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 YIL100WYIL100W 354 nt12.03□□□□□ -0.48
SPE4Q12455 RRT12YCR045C 1476 nt12.02□□□□□ -0.49
SPE4Q12455 YNL195CYNL195C 786 nt12□□□□□ -0.49
SPE4Q12455 YLR236CYLR236C 324 nt11.96□□□□□ -0.49
SPE4Q12455 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.94□□□□□ -0.5
SPE4Q12455 PIB2YGL023C 1908 nt11.92□□□□□ -0.5
SPE4Q12455 YOR139CYOR139C 393 nt11.91□□□□□ -0.5
SPE4Q12455 RTF1YGL244W 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
SPE4Q12455 PAC11YDR488C 1602 nt11.87□□□□□ -0.51
SPE4Q12455 MOT3YMR070W 1473 nt11.83□□□□□ -0.52
SPE4Q12455 WHI5YOR083W 888 nt11.83□□□□□ -0.52
SPE4Q12455 BOP3YNL042W 1191 nt11.81□□□□□ -0.52
SPE4Q12455 YLR281CYLR281C 468 nt11.79□□□□□ -0.52
SPE4Q12455 IDH1YNL037C 1083 nt11.71□□□□□ -0.53
SPE4Q12455 PTK1YKL198C 1989 nt11.7□□□□□ -0.54
SPE4Q12455 NCP1YHR042W 2076 nt11.68□□□□□ -0.54
SPE4Q12455 RRD1YIL153W 1182 nt11.66□□□□□ -0.54
SPE4Q12455 GBP2YCL011C 1284 nt11.66□□□□□ -0.54
SPE4Q12455 LCB1YMR296C 1677 nt11.6□□□□□ -0.55
SPE4Q12455 TCD2YKL027W 1344 nt11.6□□□□□ -0.55
SPE4Q12455 DED1YOR204W 1815 nt11.58□□□□□ -0.56
SPE4Q12455 FMP52YER004W 696 nt11.57□□□□□ -0.56
SPE4Q12455 PUS2YGL063W 1113 nt11.57□□□□□ -0.56
SPE4Q12455 IMP2'YIL154C 1041 nt11.56□□□□□ -0.56
SPE4Q12455 DSK2YMR276W 1122 nt11.55□□□□□ -0.56
SPE4Q12455 PCM1YEL058W 1674 nt11.51□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 FMT1YBL013W 1206 nt11.5□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 YFL054CYFL054C 1941 nt11.5□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 YDR433WYDR433W 441 nt11.48□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 SIM1YIL123W 1431 nt11.48□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.47□□□□□ -0.57
SPE4Q12455 CWP1YKL096W 720 nt11.44□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 ADH2YMR303C 1047 nt11.44□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 YPR011CYPR011C 981 nt11.44□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 MXR2YCL033C 507 nt11.44□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 FMP45YDL222C 930 nt11.42□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 SNF6YHL025W 999 nt11.41□□□□□ -0.58
SPE4Q12455 SPT8YLR055C 1809 nt11.39□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 BIO4YNR057C 714 nt11.38□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 SOR2YDL246C 1074 nt11.36□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 SOR1YJR159W 1074 nt11.36□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 LPX1YOR084W 1164 nt11.35□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 YCL042WYCL042W 360 nt11.35□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 LYS4YDR234W 2082 nt11.35□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 ERV46YAL042W 1248 nt11.34□□□□□ -0.59
SPE4Q12455 NVJ2YPR091C 2313 nt11.31□□□□□ -0.6
SPE4Q12455 YKR040CYKR040C 504 nt11.3□□□□□ -0.6
SPE4Q12455 FRD1YEL047C 1413 nt11.26□□□□□ -0.61
SPE4Q12455 YIH1YCR059C 777 nt11.25□□□□□ -0.61
SPE4Q12455 ERF2YLR246W 1080 nt11.23□□□□□ -0.61
SPE4Q12455 SWE1YJL187C 2460 nt11.21□□□□□ -0.61
SPE4Q12455 YLL053CYLL053C 459 nt11.2□□□□□ -0.62
SPE4Q12455 CRR1YLR213C 1269 nt11.2□□□□□ -0.62
SPE4Q12455 RNQ1YCL028W 1218 nt11.2□□□□□ -0.62
SPE4Q12455 ATF2YGR177C 1608 nt11.12□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 DIC1YLR348C 897 nt11.11□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 BOR1YNL275W 1731 nt11.1□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 HEM12YDR047W 1089 nt11.1□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.1□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 YJL225CYJL225C 5277 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 FTR1YER145C 1215 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 MIC10YCL057C-A 294 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE4Q12455 YFL067WYFL067W 528 nt11.07□□□□□ -0.64
SPE4Q12455 GAL1YBR020W 1587 nt11.06□□□□□ -0.64
SPE4Q12455 SNG1YGR197C 1644 nt11.06□□□□□ -0.64
SPE4Q12455 TRM5YHR070W 1500 nt11.05□□□□□ -0.64
SPE4Q12455 DDR2YOL052C-A 186 nt11.02□□□□□ -0.65
SPE4Q12455 RAX1YOR301W 1308 nt11.01□□□□□ -0.65
SPE4Q12455 PTH1YHR189W 573 nt10.99□□□□□ -0.65
SPE4Q12455 SPP1YPL138C 1062 nt10.97□□□□□ -0.65
SPE4Q12455 HSP60YLR259C 1719 nt10.97□□□□□ -0.65
SPE4Q12455 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.96□□□□□ -0.65
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