Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 YLR281CYLR281C 468 nt12.56□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.55□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.55□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.55□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.55□□□□□ -0.4
OCA6Q12454 YDL221WYDL221W 552 nt12.52□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 SIS1YNL007C 1059 nt12.52□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 WHI5YOR083W 888 nt12.52□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 SDH1YKL148C 1923 nt12.51□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 PTP1YDL230W 1008 nt12.48□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 RPP2AYOL039W 321 nt12.48□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.47□□□□□ -0.41
OCA6Q12454 NVJ2YPR091C 2313 nt12.45□□□□□ -0.42
OCA6Q12454 PUS2YGL063W 1113 nt12.45□□□□□ -0.42
OCA6Q12454 CAC2YML102W 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
OCA6Q12454 PCH2YBR186W 1695 nt12.43□□□□□ -0.42
OCA6Q12454 TIR4YOR009W 1464 nt12.4□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 GUT2YIL155C 1950 nt12.39□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 ART5YGR068C 1761 nt12.37□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 YJL152WYJL152W 360 nt12.36□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 YCH1YGR203W 447 nt12.34□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 SEC11YIR022W 504 nt12.34□□□□□ -0.43
OCA6Q12454 SCC4YER147C 1875 nt12.31□□□□□ -0.44
OCA6Q12454 GFD2YCL036W 1701 nt12.31□□□□□ -0.44
OCA6Q12454 YPR011CYPR011C 981 nt12.31□□□□□ -0.44
OCA6Q12454 YLR236CYLR236C 324 nt12.29□□□□□ -0.44
OCA6Q12454 IRC15YPL017C 1500 nt12.26□□□□□ -0.45
OCA6Q12454 PET9YBL030C 957 nt12.25□□□□□ -0.45
OCA6Q12454 DSK2YMR276W 1122 nt12.25□□□□□ -0.45
OCA6Q12454 YMR057CYMR057C 372 nt12.24□□□□□ -0.45
OCA6Q12454 PIB2YGL023C 1908 nt12.21□□□□□ -0.46
OCA6Q12454 RTS2YOR077W 699 nt12.19□□□□□ -0.46
OCA6Q12454 GIS3YLR094C 1509 nt12.18□□□□□ -0.46
OCA6Q12454 IMP2'YIL154C 1041 nt12.16□□□□□ -0.46
OCA6Q12454 FMP45YDL222C 930 nt12.15□□□□□ -0.46
OCA6Q12454 YSC84YHR016C 1407 nt12.14□□□□□ -0.47
OCA6Q12454 IDH1YNL037C 1083 nt12.13□□□□□ -0.47
OCA6Q12454 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.08□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 FPS1YLL043W 2010 nt12.08□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 LPX1YOR084W 1164 nt12.07□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 YHL050CYHL050C 2094 nt12.06□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 GBP2YCL011C 1284 nt12.05□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 MOT3YMR070W 1473 nt12.05□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 RTF1YGL244W 1677 nt12.05□□□□□ -0.48
OCA6Q12454 CUE1YMR264W 612 nt12.02□□□□□ -0.49
OCA6Q12454 YDR433WYDR433W 441 nt12.01□□□□□ -0.49
OCA6Q12454 ERV46YAL042W 1248 nt12□□□□□ -0.49
OCA6Q12454 MXR2YCL033C 507 nt11.98□□□□□ -0.49
OCA6Q12454 RRT12YCR045C 1476 nt11.95□□□□□ -0.5
OCA6Q12454 RRD1YIL153W 1182 nt11.91□□□□□ -0.5
OCA6Q12454 BOP3YNL042W 1191 nt11.91□□□□□ -0.5
OCA6Q12454 DED1YOR204W 1815 nt11.9□□□□□ -0.5
OCA6Q12454 PTK1YKL198C 1989 nt11.9□□□□□ -0.5
OCA6Q12454 TCD2YKL027W 1344 nt11.89□□□□□ -0.51
OCA6Q12454 YKR040CYKR040C 504 nt11.89□□□□□ -0.51
OCA6Q12454 SPP1YPL138C 1062 nt11.88□□□□□ -0.51
OCA6Q12454 YIL100WYIL100W 354 nt11.84□□□□□ -0.51
OCA6Q12454 FMT1YBL013W 1206 nt11.8□□□□□ -0.52
OCA6Q12454 YNL195CYNL195C 786 nt11.77□□□□□ -0.53
OCA6Q12454 FRD1YEL047C 1413 nt11.74□□□□□ -0.53
OCA6Q12454 BOR1YNL275W 1731 nt11.68□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 NCP1YHR042W 2076 nt11.67□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 SOR2YDL246C 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 SOR1YJR159W 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 FMP52YER004W 696 nt11.66□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 CWP1YKL096W 720 nt11.65□□□□□ -0.54
OCA6Q12454 ADH2YMR303C 1047 nt11.64□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 YCL042WYCL042W 360 nt11.64□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 YFL054CYFL054C 1941 nt11.62□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 UME6YDR207C 2511 nt11.61□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 RTG1YOL067C 534 nt11.6□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 PCM1YEL058W 1674 nt11.59□□□□□ -0.55
OCA6Q12454 PTH1YHR189W 573 nt11.57□□□□□ -0.56
OCA6Q12454 SPT8YLR055C 1809 nt11.57□□□□□ -0.56
OCA6Q12454 MRPL8YJL063C 717 nt11.52□□□□□ -0.57
OCA6Q12454 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.51□□□□□ -0.57
OCA6Q12454 YEL076CYEL076C 651 nt11.51□□□□□ -0.57
OCA6Q12454 SNF6YHL025W 999 nt11.51□□□□□ -0.57
OCA6Q12454 YLR464WYLR464W 651 nt11.51□□□□□ -0.57
OCA6Q12454 YLR235CYLR235C 399 nt11.43□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 DIC1YLR348C 897 nt11.42□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 LCB1YMR296C 1677 nt11.41□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 YIH1YCR059C 777 nt11.4□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 ADO1YJR105W 1023 nt11.4□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 YKL030WYKL030W 606 nt11.4□□□□□ -0.58
OCA6Q12454 BIO4YNR057C 714 nt11.39□□□□□ -0.59
OCA6Q12454 SIM1YIL123W 1431 nt11.38□□□□□ -0.59
OCA6Q12454 RNQ1YCL028W 1218 nt11.38□□□□□ -0.59
OCA6Q12454 HSP60YLR259C 1719 nt11.35□□□□□ -0.59
OCA6Q12454 SWE1YJL187C 2460 nt11.34□□□□□ -0.59
OCA6Q12454 TIM23YNR017W 669 nt11.33□□□□□ -0.6
OCA6Q12454 HUA1YGR268C 597 nt11.32□□□□□ -0.6
OCA6Q12454 YLL053CYLL053C 459 nt11.32□□□□□ -0.6
OCA6Q12454 MCH5YOR306C 1566 nt11.31□□□□□ -0.6
OCA6Q12454 YLR179CYLR179C 606 nt11.27□□□□□ -0.61
OCA6Q12454 ALG12YNR030W 1656 nt11.27□□□□□ -0.61
OCA6Q12454 FTR1YER145C 1215 nt11.23□□□□□ -0.61
OCA6Q12454 GAL1YBR020W 1587 nt11.2□□□□□ -0.62
OCA6Q12454 WSC2YNL283C 1512 nt11.2□□□□□ -0.62
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