Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 MOT3YMR070W 1473 nt12.63□□□□□ -0.39
LPX1Q12405 YLR236CYLR236C 324 nt12.59□□□□□ -0.39
LPX1Q12405 IMP2'YIL154C 1041 nt12.58□□□□□ -0.4
LPX1Q12405 FMP45YDL222C 930 nt12.57□□□□□ -0.4
LPX1Q12405 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.56□□□□□ -0.4
LPX1Q12405 SIS1YNL007C 1059 nt12.56□□□□□ -0.4
LPX1Q12405 YJL152WYJL152W 360 nt12.54□□□□□ -0.4
LPX1Q12405 SPT5YML010W 3192 nt12.47□□□□□ -0.41
LPX1Q12405 YCH1YGR203W 447 nt12.45□□□□□ -0.42
LPX1Q12405 RPP2AYOL039W 321 nt12.44□□□□□ -0.42
LPX1Q12405 TIR4YOR009W 1464 nt12.43□□□□□ -0.42
LPX1Q12405 MEP2YNL142W 1500 nt12.41□□□□□ -0.42
LPX1Q12405 IDH1YNL037C 1083 nt12.39□□□□□ -0.43
LPX1Q12405 PTP1YDL230W 1008 nt12.38□□□□□ -0.43
LPX1Q12405 LPX1YOR084W 1164 nt12.37□□□□□ -0.43
LPX1Q12405 ART5YGR068C 1761 nt12.34□□□□□ -0.43
LPX1Q12405 ERV46YAL042W 1248 nt12.33□□□□□ -0.44
LPX1Q12405 PET9YBL030C 957 nt12.29□□□□□ -0.44
LPX1Q12405 YDR433WYDR433W 441 nt12.28□□□□□ -0.44
LPX1Q12405 YMR057CYMR057C 372 nt12.28□□□□□ -0.44
LPX1Q12405 GBP2YCL011C 1284 nt12.27□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 GFD2YCL036W 1701 nt12.26□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 CAC2YML102W 1407 nt12.26□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 DCW1YKL046C 1350 nt12.24□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 SPP1YPL138C 1062 nt12.24□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 YKR040CYKR040C 504 nt12.23□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 MRPL8YJL063C 717 nt12.21□□□□□ -0.45
LPX1Q12405 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.19□□□□□ -0.46
LPX1Q12405 MXR2YCL033C 507 nt12.18□□□□□ -0.46
LPX1Q12405 EMI2YDR516C 1503 nt12.09□□□□□ -0.47
LPX1Q12405 TCD2YKL027W 1344 nt12.09□□□□□ -0.47
LPX1Q12405 RTG1YOL067C 534 nt12.08□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 RTS2YOR077W 699 nt12.08□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.07□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 YEL076CYEL076C 651 nt12.07□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 FPS1YLL043W 2010 nt12.07□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 YLR464WYLR464W 651 nt12.07□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 ADO1YJR105W 1023 nt12.05□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 IRC15YPL017C 1500 nt12.04□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 DED1YOR204W 1815 nt12.03□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
LPX1Q12405 RRD1YIL153W 1182 nt12.01□□□□□ -0.49
LPX1Q12405 YMR090WYMR090W 684 nt11.96□□□□□ -0.49
LPX1Q12405 CUE1YMR264W 612 nt11.96□□□□□ -0.49
LPX1Q12405 FRD1YEL047C 1413 nt11.95□□□□□ -0.5
LPX1Q12405 GIS3YLR094C 1509 nt11.95□□□□□ -0.5
LPX1Q12405 FMT1YBL013W 1206 nt11.9□□□□□ -0.5
LPX1Q12405 SSA4YER103W 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
LPX1Q12405 YCL042WYCL042W 360 nt11.85□□□□□ -0.51
LPX1Q12405 SOR2YDL246C 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
LPX1Q12405 SOR1YJR159W 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
LPX1Q12405 HUA1YGR268C 597 nt11.83□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 SDH1YKL148C 1923 nt11.82□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 Q0182Q0182 405 nt11.82□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 PTH1YHR189W 573 nt11.82□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 UBX6YJL048C 1191 nt11.82□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 SCC4YER147C 1875 nt11.8□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 YIL100WYIL100W 354 nt11.8□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 YBR220CYBR220C 1683 nt11.78□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 FMP52YER004W 696 nt11.78□□□□□ -0.52
LPX1Q12405 YLR235CYLR235C 399 nt11.75□□□□□ -0.53
LPX1Q12405 YKL030WYKL030W 606 nt11.73□□□□□ -0.53
LPX1Q12405 CWP1YKL096W 720 nt11.73□□□□□ -0.53
LPX1Q12405 ADH2YMR303C 1047 nt11.71□□□□□ -0.53
LPX1Q12405 LCB1YMR296C 1677 nt11.68□□□□□ -0.54
LPX1Q12405 YDR094WYDR094W 336 nt11.66□□□□□ -0.54
LPX1Q12405 PCM1YEL058W 1674 nt11.62□□□□□ -0.55
LPX1Q12405 SNF6YHL025W 999 nt11.58□□□□□ -0.56
LPX1Q12405 DIC1YLR348C 897 nt11.56□□□□□ -0.56
LPX1Q12405 YNL195CYNL195C 786 nt11.55□□□□□ -0.56
LPX1Q12405 TIM23YNR017W 669 nt11.55□□□□□ -0.56
LPX1Q12405 RRT12YCR045C 1476 nt11.53□□□□□ -0.56
LPX1Q12405 RNQ1YCL028W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
LPX1Q12405 YIH1YCR059C 777 nt11.49□□□□□ -0.57
LPX1Q12405 YLR179CYLR179C 606 nt11.48□□□□□ -0.57
LPX1Q12405 YSC84YHR016C 1407 nt11.47□□□□□ -0.57
LPX1Q12405 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.45□□□□□ -0.58
LPX1Q12405 YHL050CYHL050C 2094 nt11.44□□□□□ -0.58
LPX1Q12405 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.44□□□□□ -0.58
LPX1Q12405 YPR064WYPR064W 420 nt11.42□□□□□ -0.58
LPX1Q12405 WSC2YNL283C 1512 nt11.39□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 YLL053CYLL053C 459 nt11.38□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 YFR018CYFR018C 1092 nt11.37□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 AHT1YHR093W 549 nt11.37□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 TAD3YLR316C 969 nt11.37□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 BIO4YNR057C 714 nt11.37□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 BDF1YLR399C 2061 nt11.36□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 SIM1YIL123W 1431 nt11.35□□□□□ -0.59
LPX1Q12405 PAC11YDR488C 1602 nt11.32□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 FTR1YER145C 1215 nt11.32□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 PAU16YKL224C 372 nt11.31□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 PRE6YOL038W 765 nt11.3□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 SEC11YIR022W 504 nt11.29□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 AQY1YPR192W 918 nt11.28□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 GAL1YBR020W 1587 nt11.28□□□□□ -0.6
LPX1Q12405 RRT5YFR032C 870 nt11.27□□□□□ -0.61
LPX1Q12405 TRM5YHR070W 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
LPX1Q12405 TAT1YBR069C 1860 nt11.22□□□□□ -0.61
LPX1Q12405 YFL066CYFL066C 1179 nt11.2□□□□□ -0.62
LPX1Q12405 BDH1YAL060W 1149 nt11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms