Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YLR236CYLR236C 324 nt15.44■□□□□ 0.06
NOP53Q12080 IMP2'YIL154C 1041 nt15.38■□□□□ 0.05
NOP53Q12080 ALF1YNL148C 765 nt15.35■□□□□ 0.05
NOP53Q12080 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.34■□□□□ 0.05
NOP53Q12080 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.34■□□□□ 0.05
NOP53Q12080 YCH1YGR203W 447 nt15.32■□□□□ 0.04
NOP53Q12080 YJL152WYJL152W 360 nt15.25■□□□□ 0.03
NOP53Q12080 YPS1YLR120C 1710 nt15.23■□□□□ 0.03
NOP53Q12080 YDR095CYDR095C 411 nt15.2■□□□□ 0.02
NOP53Q12080 LPX1YOR084W 1164 nt15.15■□□□□ 0.02
NOP53Q12080 MRPL8YJL063C 717 nt15.13■□□□□ 0.01
NOP53Q12080 SIS1YNL007C 1059 nt15.1■□□□□ 0.01
NOP53Q12080 IDH1YNL037C 1083 nt15.1■□□□□ 0.01
NOP53Q12080 ERV46YAL042W 1248 nt15.08■□□□□ 0
NOP53Q12080 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.05■□□□□ -0
NOP53Q12080 SPP1YPL138C 1062 nt15.05■□□□□ -0
NOP53Q12080 PAC11YDR488C 1602 nt15.03■□□□□ -0
NOP53Q12080 TIR4YOR009W 1464 nt15.02■□□□□ -0
NOP53Q12080 YDR433WYDR433W 441 nt15.02■□□□□ -0
NOP53Q12080 CSM2YIL132C 642 nt14.99□□□□□ -0.01
NOP53Q12080 SSA4YER103W 1929 nt14.97□□□□□ -0.01
NOP53Q12080 YKR040CYKR040C 504 nt14.93□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 RPP2AYOL039W 321 nt14.93□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 GBP2YCL011C 1284 nt14.93□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.92□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 YEL076CYEL076C 651 nt14.92□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 ADO1YJR105W 1023 nt14.92□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 YLR464WYLR464W 651 nt14.92□□□□□ -0.02
NOP53Q12080 RTG1YOL067C 534 nt14.88□□□□□ -0.03
NOP53Q12080 MXR2YCL033C 507 nt14.87□□□□□ -0.03
NOP53Q12080 ART5YGR068C 1761 nt14.85□□□□□ -0.03
NOP53Q12080 PTP1YDL230W 1008 nt14.83□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 YMR057CYMR057C 372 nt14.82□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 CAC2YML102W 1407 nt14.82□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 NVJ2YPR091C 2313 nt14.81□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 PET9YBL030C 957 nt14.79□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 MEP2YNL142W 1500 nt14.77□□□□□ -0.04
NOP53Q12080 UBX6YJL048C 1191 nt14.77□□□□□ -0.05
NOP53Q12080 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.76□□□□□ -0.05
NOP53Q12080 GFD2YCL036W 1701 nt14.74□□□□□ -0.05
NOP53Q12080 TCD2YKL027W 1344 nt14.68□□□□□ -0.06
NOP53Q12080 SPT5YML010W 3192 nt14.67□□□□□ -0.06
NOP53Q12080 PAU21YOR394W 495 nt14.64□□□□□ -0.07
NOP53Q12080 PAU22YPL282C 495 nt14.64□□□□□ -0.07
NOP53Q12080 HUA1YGR268C 597 nt14.59□□□□□ -0.07
NOP53Q12080 DCW1YKL046C 1350 nt14.59□□□□□ -0.07
NOP53Q12080 DED1YOR204W 1815 nt14.57□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 BDF1YLR399C 2061 nt14.56□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 FRD1YEL047C 1413 nt14.55□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 RRD1YIL153W 1182 nt14.54□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 RTS2YOR077W 699 nt14.54□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 FPS1YLL043W 2010 nt14.53□□□□□ -0.08
NOP53Q12080 ARO7YPR060C 771 nt14.52□□□□□ -0.09
NOP53Q12080 PTH1YHR189W 573 nt14.45□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 YDR094WYDR094W 336 nt14.44□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 EMI2YDR516C 1503 nt14.41□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 FMT1YBL013W 1206 nt14.41□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 YCL042WYCL042W 360 nt14.41□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 IRC15YPL017C 1500 nt14.41□□□□□ -0.1
NOP53Q12080 YKL030WYKL030W 606 nt14.36□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 CUE1YMR264W 612 nt14.36□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 SOR2YDL246C 1074 nt14.35□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 SOR1YJR159W 1074 nt14.35□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 YDL221WYDL221W 552 nt14.34□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 YLR235CYLR235C 399 nt14.34□□□□□ -0.11
NOP53Q12080 TAT1YBR069C 1860 nt14.31□□□□□ -0.12
NOP53Q12080 GIS3YLR094C 1509 nt14.27□□□□□ -0.12
NOP53Q12080 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.27□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 LCB1YMR296C 1677 nt14.26□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 PAM17YKR065C 594 nt14.26□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 YMR090WYMR090W 684 nt14.24□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 CWP1YKL096W 720 nt14.23□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 FMP52YER004W 696 nt14.22□□□□□ -0.13
NOP53Q12080 YIL100WYIL100W 354 nt14.19□□□□□ -0.14
NOP53Q12080 ADH2YMR303C 1047 nt14.18□□□□□ -0.14
NOP53Q12080 REG2YBR050C 1017 nt14.1□□□□□ -0.15
NOP53Q12080 TIM23YNR017W 669 nt14.08□□□□□ -0.16
NOP53Q12080 SCC4YER147C 1875 nt14.07□□□□□ -0.16
NOP53Q12080 SDH1YKL148C 1923 nt14.05□□□□□ -0.16
NOP53Q12080 DIC1YLR348C 897 nt14.05□□□□□ -0.16
NOP53Q12080 PCM1YEL058W 1674 nt14.02□□□□□ -0.16
NOP53Q12080 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.01□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 SNF6YHL025W 999 nt14□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 PAU16YKL224C 372 nt14□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 YLR179CYLR179C 606 nt13.98□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 YFR018CYFR018C 1092 nt13.97□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 YBR220CYBR220C 1683 nt13.96□□□□□ -0.17
NOP53Q12080 PRE6YOL038W 765 nt13.93□□□□□ -0.18
NOP53Q12080 RNQ1YCL028W 1218 nt13.92□□□□□ -0.18
NOP53Q12080 YPR064WYPR064W 420 nt13.91□□□□□ -0.18
NOP53Q12080 RRT5YFR032C 870 nt13.9□□□□□ -0.18
NOP53Q12080 YIH1YCR059C 777 nt13.88□□□□□ -0.19
NOP53Q12080 SBA1YKL117W 651 nt13.86□□□□□ -0.19
NOP53Q12080 TAD3YLR316C 969 nt13.85□□□□□ -0.19
NOP53Q12080 WSC2YNL283C 1512 nt13.85□□□□□ -0.19
NOP53Q12080 YNL195CYNL195C 786 nt13.83□□□□□ -0.2
NOP53Q12080 AHT1YHR093W 549 nt13.81□□□□□ -0.2
NOP53Q12080 BUR6YER159C 429 nt13.79□□□□□ -0.2
NOP53Q12080 RRT12YCR045C 1476 nt13.76□□□□□ -0.21
NOP53Q12080 YLL053CYLL053C 459 nt13.74□□□□□ -0.21
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