Protein–RNA interactions for Protein: Q08887

NDD1, Nuclear division defective protein 1, yeastyeast

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDD1Q08887 SPT5YML010W 3192 nt12.45□□□□□ -0.42
NDD1Q08887 MOT3YMR070W 1473 nt12.45□□□□□ -0.42
NDD1Q08887 YLR236CYLR236C 324 nt12.43□□□□□ -0.42
NDD1Q08887 FMP45YDL222C 930 nt12.41□□□□□ -0.42
NDD1Q08887 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.41□□□□□ -0.42
NDD1Q08887 YJL152WYJL152W 360 nt12.39□□□□□ -0.43
NDD1Q08887 SIS1YNL007C 1059 nt12.39□□□□□ -0.43
NDD1Q08887 IMP2'YIL154C 1041 nt12.38□□□□□ -0.43
NDD1Q08887 YCH1YGR203W 447 nt12.3□□□□□ -0.44
NDD1Q08887 TIR4YOR009W 1464 nt12.28□□□□□ -0.44
NDD1Q08887 RPP2AYOL039W 321 nt12.28□□□□□ -0.44
NDD1Q08887 MEP2YNL142W 1500 nt12.27□□□□□ -0.44
NDD1Q08887 PTP1YDL230W 1008 nt12.24□□□□□ -0.45
NDD1Q08887 LPX1YOR084W 1164 nt12.22□□□□□ -0.45
NDD1Q08887 IDH1YNL037C 1083 nt12.21□□□□□ -0.45
NDD1Q08887 ART5YGR068C 1761 nt12.2□□□□□ -0.46
NDD1Q08887 ERV46YAL042W 1248 nt12.17□□□□□ -0.46
NDD1Q08887 YMR057CYMR057C 372 nt12.14□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 YDR433WYDR433W 441 nt12.13□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 GFD2YCL036W 1701 nt12.12□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 PET9YBL030C 957 nt12.12□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 DCW1YKL046C 1350 nt12.12□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 GBP2YCL011C 1284 nt12.11□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 CAC2YML102W 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 SPP1YPL138C 1062 nt12.1□□□□□ -0.47
NDD1Q08887 YKR040CYKR040C 504 nt12.05□□□□□ -0.48
NDD1Q08887 MXR2YCL033C 507 nt12.05□□□□□ -0.48
NDD1Q08887 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.03□□□□□ -0.48
NDD1Q08887 SSA4YER103W 1929 nt12□□□□□ -0.49
NDD1Q08887 MRPL8YJL063C 717 nt11.99□□□□□ -0.49
NDD1Q08887 RTS2YOR077W 699 nt11.96□□□□□ -0.49
NDD1Q08887 EMI2YDR516C 1503 nt11.96□□□□□ -0.5
NDD1Q08887 FPS1YLL043W 2010 nt11.93□□□□□ -0.5
NDD1Q08887 TCD2YKL027W 1344 nt11.92□□□□□ -0.5
NDD1Q08887 RTG1YOL067C 534 nt11.91□□□□□ -0.5
NDD1Q08887 IRC15YPL017C 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
NDD1Q08887 DED1YOR204W 1815 nt11.88□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 YDL221WYDL221W 552 nt11.88□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.88□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 YEL076CYEL076C 651 nt11.88□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 YLR464WYLR464W 651 nt11.88□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 RRD1YIL153W 1182 nt11.86□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 ADO1YJR105W 1023 nt11.85□□□□□ -0.51
NDD1Q08887 CUE1YMR264W 612 nt11.82□□□□□ -0.52
NDD1Q08887 YMR090WYMR090W 684 nt11.81□□□□□ -0.52
NDD1Q08887 GIS3YLR094C 1509 nt11.81□□□□□ -0.52
NDD1Q08887 FRD1YEL047C 1413 nt11.8□□□□□ -0.52
NDD1Q08887 FMT1YBL013W 1206 nt11.76□□□□□ -0.53
NDD1Q08887 YCL042WYCL042W 360 nt11.7□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 SDH1YKL148C 1923 nt11.69□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 SOR2YDL246C 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 PTH1YHR189W 573 nt11.67□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 UBX6YJL048C 1191 nt11.67□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 SOR1YJR159W 1074 nt11.67□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 SCC4YER147C 1875 nt11.67□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 YIL100WYIL100W 354 nt11.66□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 HUA1YGR268C 597 nt11.65□□□□□ -0.54
NDD1Q08887 YBR220CYBR220C 1683 nt11.64□□□□□ -0.55
NDD1Q08887 FMP52YER004W 696 nt11.61□□□□□ -0.55
NDD1Q08887 CWP1YKL096W 720 nt11.6□□□□□ -0.55
NDD1Q08887 BDF1YLR399C 2061 nt11.59□□□□□ -0.55
NDD1Q08887 ADH2YMR303C 1047 nt11.58□□□□□ -0.56
NDD1Q08887 YKL030WYKL030W 606 nt11.57□□□□□ -0.56
NDD1Q08887 YLR235CYLR235C 399 nt11.57□□□□□ -0.56
NDD1Q08887 LCB1YMR296C 1677 nt11.52□□□□□ -0.56
NDD1Q08887 PCM1YEL058W 1674 nt11.48□□□□□ -0.57
NDD1Q08887 YDR094WYDR094W 336 nt11.47□□□□□ -0.57
NDD1Q08887 SNF6YHL025W 999 nt11.44□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 DIC1YLR348C 897 nt11.42□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 TAT1YBR069C 1860 nt11.41□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 RRT12YCR045C 1476 nt11.41□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 YNL195CYNL195C 786 nt11.41□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 TIM23YNR017W 669 nt11.4□□□□□ -0.58
NDD1Q08887 YSC84YHR016C 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
NDD1Q08887 YIH1YCR059C 777 nt11.34□□□□□ -0.59
NDD1Q08887 RNQ1YCL028W 1218 nt11.34□□□□□ -0.59
NDD1Q08887 YLR179CYLR179C 606 nt11.33□□□□□ -0.6
NDD1Q08887 YHL050CYHL050C 2094 nt11.32□□□□□ -0.6
NDD1Q08887 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.28□□□□□ -0.6
NDD1Q08887 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.27□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 YPR064WYPR064W 420 nt11.25□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 YLL053CYLL053C 459 nt11.24□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 BIO4YNR057C 714 nt11.24□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 WSC2YNL283C 1512 nt11.24□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 SIM1YIL123W 1431 nt11.23□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 AHT1YHR093W 549 nt11.21□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 TAD3YLR316C 969 nt11.21□□□□□ -0.61
NDD1Q08887 YFR018CYFR018C 1092 nt11.19□□□□□ -0.62
NDD1Q08887 FTR1YER145C 1215 nt11.17□□□□□ -0.62
NDD1Q08887 PAU16YKL224C 372 nt11.16□□□□□ -0.62
NDD1Q08887 PRE6YOL038W 765 nt11.16□□□□□ -0.62
NDD1Q08887 SEC11YIR022W 504 nt11.14□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 GAL1YBR020W 1587 nt11.14□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 TRM5YHR070W 1500 nt11.11□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 AQY1YPR192W 918 nt11.11□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 PCH2YBR186W 1695 nt11.09□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 RRT5YFR032C 870 nt11.09□□□□□ -0.63
NDD1Q08887 YFL066CYFL066C 1179 nt11.06□□□□□ -0.64
NDD1Q08887 GUT2YIL155C 1950 nt11.06□□□□□ -0.64
NDD1Q08887 ATF2YGR177C 1608 nt11.06□□□□□ -0.64
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