Protein–RNA interactions for Protein: Q06549

CDD1, Cytidine deaminase, yeastyeast

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDD1Q06549 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.04□□□□□ -0.32
CDD1Q06549 SIS1YNL007C 1059 nt13.04□□□□□ -0.32
CDD1Q06549 YLR236CYLR236C 324 nt13.01□□□□□ -0.33
CDD1Q06549 DSK2YMR276W 1122 nt13□□□□□ -0.33
CDD1Q06549 MOT3YMR070W 1473 nt12.97□□□□□ -0.33
CDD1Q06549 MEP2YNL142W 1500 nt12.96□□□□□ -0.33
CDD1Q06549 YJL152WYJL152W 360 nt12.94□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 FMP45YDL222C 930 nt12.93□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 PTP1YDL230W 1008 nt12.92□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 YCH1YGR203W 447 nt12.92□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 IMP2'YIL154C 1041 nt12.92□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 RPP2AYOL039W 321 nt12.92□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 TIR4YOR009W 1464 nt12.91□□□□□ -0.34
CDD1Q06549 ART5YGR068C 1761 nt12.84□□□□□ -0.35
CDD1Q06549 DCW1YKL046C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
CDD1Q06549 LPX1YOR084W 1164 nt12.78□□□□□ -0.36
CDD1Q06549 CAC2YML102W 1407 nt12.78□□□□□ -0.36
CDD1Q06549 IDH1YNL037C 1083 nt12.76□□□□□ -0.37
CDD1Q06549 GFD2YCL036W 1701 nt12.76□□□□□ -0.37
CDD1Q06549 PET9YBL030C 957 nt12.75□□□□□ -0.37
CDD1Q06549 YMR057CYMR057C 372 nt12.74□□□□□ -0.37
CDD1Q06549 ERV46YAL042W 1248 nt12.72□□□□□ -0.37
CDD1Q06549 GBP2YCL011C 1284 nt12.67□□□□□ -0.38
CDD1Q06549 YDR433WYDR433W 441 nt12.66□□□□□ -0.38
CDD1Q06549 SPP1YPL138C 1062 nt12.65□□□□□ -0.38
CDD1Q06549 EMI2YDR516C 1503 nt12.62□□□□□ -0.39
CDD1Q06549 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
CDD1Q06549 YKR040CYKR040C 504 nt12.6□□□□□ -0.39
CDD1Q06549 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.59□□□□□ -0.39
CDD1Q06549 IRC15YPL017C 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
CDD1Q06549 RTS2YOR077W 699 nt12.57□□□□□ -0.4
CDD1Q06549 FPS1YLL043W 2010 nt12.56□□□□□ -0.4
CDD1Q06549 YDL221WYDL221W 552 nt12.54□□□□□ -0.4
CDD1Q06549 DED1YOR204W 1815 nt12.49□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 SSA4YER103W 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 TCD2YKL027W 1344 nt12.47□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 MRPL8YJL063C 717 nt12.47□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 GIS3YLR094C 1509 nt12.47□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 RRD1YIL153W 1182 nt12.46□□□□□ -0.41
CDD1Q06549 RTG1YOL067C 534 nt12.44□□□□□ -0.42
CDD1Q06549 YMR090WYMR090W 684 nt12.43□□□□□ -0.42
CDD1Q06549 CUE1YMR264W 612 nt12.43□□□□□ -0.42
CDD1Q06549 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.38□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 YEL076CYEL076C 651 nt12.38□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 YLR464WYLR464W 651 nt12.38□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 FRD1YEL047C 1413 nt12.37□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 FMT1YBL013W 1206 nt12.36□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 SDH1YKL148C 1923 nt12.35□□□□□ -0.43
CDD1Q06549 YBR220CYBR220C 1683 nt12.33□□□□□ -0.44
CDD1Q06549 SCC4YER147C 1875 nt12.31□□□□□ -0.44
CDD1Q06549 ADO1YJR105W 1023 nt12.3□□□□□ -0.44
CDD1Q06549 SOR2YDL246C 1074 nt12.25□□□□□ -0.45
CDD1Q06549 SOR1YJR159W 1074 nt12.25□□□□□ -0.45
CDD1Q06549 YIL100WYIL100W 354 nt12.23□□□□□ -0.45
CDD1Q06549 YCL042WYCL042W 360 nt12.22□□□□□ -0.45
CDD1Q06549 PTH1YHR189W 573 nt12.2□□□□□ -0.46
CDD1Q06549 FMP52YER004W 696 nt12.18□□□□□ -0.46
CDD1Q06549 CWP1YKL096W 720 nt12.16□□□□□ -0.46
CDD1Q06549 ADH2YMR303C 1047 nt12.15□□□□□ -0.46
CDD1Q06549 UBX6YJL048C 1191 nt12.13□□□□□ -0.47
CDD1Q06549 HUA1YGR268C 597 nt12.12□□□□□ -0.47
CDD1Q06549 YLR235CYLR235C 399 nt12.08□□□□□ -0.48
CDD1Q06549 YKL030WYKL030W 606 nt12.07□□□□□ -0.48
CDD1Q06549 PCM1YEL058W 1674 nt12.06□□□□□ -0.48
CDD1Q06549 LCB1YMR296C 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
CDD1Q06549 RRT12YCR045C 1476 nt12.05□□□□□ -0.48
CDD1Q06549 SNF6YHL025W 999 nt11.99□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 BDF1YLR399C 2061 nt11.99□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 YSC84YHR016C 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 YNL195CYNL195C 786 nt11.98□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 YHL050CYHL050C 2094 nt11.98□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 DIC1YLR348C 897 nt11.96□□□□□ -0.49
CDD1Q06549 YDR094WYDR094W 336 nt11.94□□□□□ -0.5
CDD1Q06549 TIM23YNR017W 669 nt11.93□□□□□ -0.5
CDD1Q06549 YIH1YCR059C 777 nt11.91□□□□□ -0.5
CDD1Q06549 RNQ1YCL028W 1218 nt11.91□□□□□ -0.5
CDD1Q06549 YLR179CYLR179C 606 nt11.85□□□□□ -0.51
CDD1Q06549 BIO4YNR057C 714 nt11.82□□□□□ -0.52
CDD1Q06549 TAT1YBR069C 1860 nt11.82□□□□□ -0.52
CDD1Q06549 YLL053CYLL053C 459 nt11.81□□□□□ -0.52
CDD1Q06549 WSC2YNL283C 1512 nt11.8□□□□□ -0.52
CDD1Q06549 SIM1YIL123W 1431 nt11.79□□□□□ -0.52
CDD1Q06549 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.77□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 SEC11YIR022W 504 nt11.77□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 AHT1YHR093W 549 nt11.76□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.75□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 YPR064WYPR064W 420 nt11.75□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 TAD3YLR316C 969 nt11.73□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 FTR1YER145C 1215 nt11.72□□□□□ -0.53
CDD1Q06549 PCH2YBR186W 1695 nt11.71□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 GAL1YBR020W 1587 nt11.71□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 YFR018CYFR018C 1092 nt11.69□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 NCP1YHR042W 2076 nt11.67□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 PRE6YOL038W 765 nt11.67□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 TRM5YHR070W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 GUT2YIL155C 1950 nt11.65□□□□□ -0.54
CDD1Q06549 AQY1YPR192W 918 nt11.64□□□□□ -0.55
CDD1Q06549 ATF2YGR177C 1608 nt11.63□□□□□ -0.55
CDD1Q06549 PAU16YKL224C 372 nt11.62□□□□□ -0.55
CDD1Q06549 SPC25YER018C 666 nt11.58□□□□□ -0.56
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