Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 ALF1YNL148C 765 nt12.49□□□□□ -0.41
HEL2Q05580 WHI5YOR083W 888 nt12.49□□□□□ -0.41
HEL2Q05580 YDR095CYDR095C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
HEL2Q05580 DCW1YKL046C 1350 nt12.42□□□□□ -0.42
HEL2Q05580 YPR011CYPR011C 981 nt12.35□□□□□ -0.43
HEL2Q05580 CCT6YDR188W 1641 nt12.32□□□□□ -0.44
HEL2Q05580 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.29□□□□□ -0.44
HEL2Q05580 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.29□□□□□ -0.44
HEL2Q05580 FMP45YDL222C 930 nt12.28□□□□□ -0.44
HEL2Q05580 RPP2AYOL039W 321 nt12.28□□□□□ -0.44
HEL2Q05580 YLR236CYLR236C 324 nt12.26□□□□□ -0.45
HEL2Q05580 DSK2YMR276W 1122 nt12.26□□□□□ -0.45
HEL2Q05580 EMI2YDR516C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
HEL2Q05580 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
HEL2Q05580 PTP1YDL230W 1008 nt12.2□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 SIS1YNL007C 1059 nt12.19□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 CAC2YML102W 1407 nt12.19□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 YCH1YGR203W 447 nt12.18□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 MRPL8YJL063C 717 nt12.18□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 IMP2'YIL154C 1041 nt12.16□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.16□□□□□ -0.46
HEL2Q05580 YDL221WYDL221W 552 nt12.12□□□□□ -0.47
HEL2Q05580 ART5YGR068C 1761 nt12.07□□□□□ -0.48
HEL2Q05580 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
HEL2Q05580 LPX1YOR084W 1164 nt12.01□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 GFD2YCL036W 1701 nt12□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 SPP1YPL138C 1062 nt12□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 RTS2YOR077W 699 nt11.98□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 IRC15YPL017C 1500 nt11.97□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 ERV46YAL042W 1248 nt11.97□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 BDF1YLR399C 2061 nt11.97□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 YJL152WYJL152W 360 nt11.96□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 ADO1YJR105W 1023 nt11.96□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 PET9YBL030C 957 nt11.96□□□□□ -0.49
HEL2Q05580 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 YEL076CYEL076C 651 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 UBX6YJL048C 1191 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 YLR464WYLR464W 651 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 TIR4YOR009W 1464 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 RTG1YOL067C 534 nt11.93□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 SCC4YER147C 1875 nt11.93□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 GIS3YLR094C 1509 nt11.92□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 YMR057CYMR057C 372 nt11.91□□□□□ -0.5
HEL2Q05580 IDH1YNL037C 1083 nt11.86□□□□□ -0.51
HEL2Q05580 TAT1YBR069C 1860 nt11.81□□□□□ -0.52
HEL2Q05580 YDR433WYDR433W 441 nt11.81□□□□□ -0.52
HEL2Q05580 YKR040CYKR040C 504 nt11.81□□□□□ -0.52
HEL2Q05580 RPM1RPM1 483 nt11.78□□□□□ -0.52
HEL2Q05580 CUE1YMR264W 612 nt11.78□□□□□ -0.52
HEL2Q05580 UME6YDR207C 2511 nt11.75□□□□□ -0.53
HEL2Q05580 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.75□□□□□ -0.53
HEL2Q05580 MXR2YCL033C 507 nt11.73□□□□□ -0.53
HEL2Q05580 YIL100WYIL100W 354 nt11.72□□□□□ -0.53
HEL2Q05580 GBP2YCL011C 1284 nt11.71□□□□□ -0.53
HEL2Q05580 YSC84YHR016C 1407 nt11.68□□□□□ -0.54
HEL2Q05580 YNL195CYNL195C 786 nt11.67□□□□□ -0.54
HEL2Q05580 SEC11YIR022W 504 nt11.64□□□□□ -0.55
HEL2Q05580 YDR094WYDR094W 336 nt11.62□□□□□ -0.55
HEL2Q05580 HUA1YGR268C 597 nt11.62□□□□□ -0.55
HEL2Q05580 RRT12YCR045C 1476 nt11.62□□□□□ -0.55
HEL2Q05580 PCH2YBR186W 1695 nt11.6□□□□□ -0.55
HEL2Q05580 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.58□□□□□ -0.56
HEL2Q05580 YHL050CYHL050C 2094 nt11.55□□□□□ -0.56
HEL2Q05580 GUT2YIL155C 1950 nt11.52□□□□□ -0.56
HEL2Q05580 TCD2YKL027W 1344 nt11.51□□□□□ -0.57
HEL2Q05580 FRD1YEL047C 1413 nt11.5□□□□□ -0.57
HEL2Q05580 DED1YOR204W 1815 nt11.49□□□□□ -0.57
HEL2Q05580 RRD1YIL153W 1182 nt11.42□□□□□ -0.58
HEL2Q05580 PTH1YHR189W 573 nt11.4□□□□□ -0.58
HEL2Q05580 YKL030WYKL030W 606 nt11.35□□□□□ -0.59
HEL2Q05580 RTF1YGL244W 1677 nt11.34□□□□□ -0.59
HEL2Q05580 FMT1YBL013W 1206 nt11.34□□□□□ -0.59
HEL2Q05580 BOP3YNL042W 1191 nt11.32□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 YLR235CYLR235C 399 nt11.31□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 SOR2YDL246C 1074 nt11.3□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 SOR1YJR159W 1074 nt11.3□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 YCL042WYCL042W 360 nt11.29□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 LCB1YMR296C 1677 nt11.29□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 FMP52YER004W 696 nt11.28□□□□□ -0.6
HEL2Q05580 PIB2YGL023C 1908 nt11.27□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 CWP1YKL096W 720 nt11.26□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 SBA1YKL117W 651 nt11.26□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 PCM1YEL058W 1674 nt11.24□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 ADH2YMR303C 1047 nt11.22□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 PAU16YKL224C 372 nt11.21□□□□□ -0.61
HEL2Q05580 SIM1YIL123W 1431 nt11.19□□□□□ -0.62
HEL2Q05580 SNF6YHL025W 999 nt11.19□□□□□ -0.62
HEL2Q05580 YFR018CYFR018C 1092 nt11.16□□□□□ -0.62
HEL2Q05580 NCP1YHR042W 2076 nt11.15□□□□□ -0.63
HEL2Q05580 PTK1YKL198C 1989 nt11.13□□□□□ -0.63
HEL2Q05580 PRE6YOL038W 765 nt11.12□□□□□ -0.63
HEL2Q05580 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.09□□□□□ -0.63
HEL2Q05580 TIM23YNR017W 669 nt11.08□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 FRE6YLL051C 2139 nt11.07□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 BIO4YNR057C 714 nt11.07□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 RRT5YFR032C 870 nt11.06□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 YFL054CYFL054C 1941 nt11.04□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 DIC1YLR348C 897 nt11.03□□□□□ -0.64
HEL2Q05580 SSN3YPL042C 1668 nt10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 140.5 ms