Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 IMP2'YIL154C 1041 nt15.37■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 Q0182Q0182 405 nt15.36■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 YJL152WYJL152W 360 nt15.36■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 MOT3YMR070W 1473 nt15.35■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 FMP45YDL222C 930 nt15.34■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 SIS1YNL007C 1059 nt15.34■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 YPR011CYPR011C 981 nt15.34■□□□□ 0.05
NSE3Q05541 YLR236CYLR236C 324 nt15.31■□□□□ 0.04
NSE3Q05541 RPP2AYOL039W 321 nt15.24■□□□□ 0.03
NSE3Q05541 MEP2YNL142W 1500 nt15.2■□□□□ 0.02
NSE3Q05541 SPT5YML010W 3192 nt15.17■□□□□ 0.02
NSE3Q05541 TIR4YOR009W 1464 nt15.17■□□□□ 0.02
NSE3Q05541 YCH1YGR203W 447 nt15.17■□□□□ 0.02
NSE3Q05541 IDH1YNL037C 1083 nt15.16■□□□□ 0.02
NSE3Q05541 PTP1YDL230W 1008 nt15.1■□□□□ 0.01
NSE3Q05541 ART5YGR068C 1761 nt15.08■□□□□ 0.01
NSE3Q05541 LPX1YOR084W 1164 nt15.06■□□□□ 0
NSE3Q05541 PET9YBL030C 957 nt15.03■□□□□ -0
NSE3Q05541 YDR433WYDR433W 441 nt15.02■□□□□ -0
NSE3Q05541 ERV46YAL042W 1248 nt15.02■□□□□ -0
NSE3Q05541 YMR057CYMR057C 372 nt15.01□□□□□ -0.01
NSE3Q05541 GBP2YCL011C 1284 nt15□□□□□ -0.01
NSE3Q05541 CAC2YML102W 1407 nt14.99□□□□□ -0.01
NSE3Q05541 GFD2YCL036W 1701 nt14.98□□□□□ -0.01
NSE3Q05541 DCW1YKL046C 1350 nt14.97□□□□□ -0.01
NSE3Q05541 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.95□□□□□ -0.02
NSE3Q05541 YKR040CYKR040C 504 nt14.91□□□□□ -0.02
NSE3Q05541 SPP1YPL138C 1062 nt14.87□□□□□ -0.03
NSE3Q05541 MXR2YCL033C 507 nt14.85□□□□□ -0.03
NSE3Q05541 MRPL8YJL063C 717 nt14.83□□□□□ -0.04
NSE3Q05541 EMI2YDR516C 1503 nt14.82□□□□□ -0.04
NSE3Q05541 TCD2YKL027W 1344 nt14.79□□□□□ -0.04
NSE3Q05541 RTS2YOR077W 699 nt14.79□□□□□ -0.04
NSE3Q05541 FPS1YLL043W 2010 nt14.73□□□□□ -0.05
NSE3Q05541 YDL221WYDL221W 552 nt14.72□□□□□ -0.05
NSE3Q05541 YMR090WYMR090W 684 nt14.72□□□□□ -0.05
NSE3Q05541 IRC15YPL017C 1500 nt14.71□□□□□ -0.06
NSE3Q05541 ADO1YJR105W 1023 nt14.68□□□□□ -0.06
NSE3Q05541 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.66□□□□□ -0.06
NSE3Q05541 YEL076CYEL076C 651 nt14.66□□□□□ -0.06
NSE3Q05541 YLR464WYLR464W 651 nt14.66□□□□□ -0.06
NSE3Q05541 CUE1YMR264W 612 nt14.64□□□□□ -0.07
NSE3Q05541 RTG1YOL067C 534 nt14.64□□□□□ -0.07
NSE3Q05541 DED1YOR204W 1815 nt14.64□□□□□ -0.07
NSE3Q05541 RRD1YIL153W 1182 nt14.63□□□□□ -0.07
NSE3Q05541 GIS3YLR094C 1509 nt14.6□□□□□ -0.07
NSE3Q05541 FRD1YEL047C 1413 nt14.56□□□□□ -0.08
NSE3Q05541 SSA4YER103W 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
NSE3Q05541 YCL042WYCL042W 360 nt14.52□□□□□ -0.09
NSE3Q05541 YIL100WYIL100W 354 nt14.5□□□□□ -0.09
NSE3Q05541 FMT1YBL013W 1206 nt14.48□□□□□ -0.09
NSE3Q05541 SDH1YKL148C 1923 nt14.47□□□□□ -0.09
NSE3Q05541 SCC4YER147C 1875 nt14.46□□□□□ -0.09
NSE3Q05541 SOR2YDL246C 1074 nt14.43□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 HUA1YGR268C 597 nt14.43□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 SOR1YJR159W 1074 nt14.43□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 FMP52YER004W 696 nt14.41□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 PTH1YHR189W 573 nt14.41□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 YBR220CYBR220C 1683 nt14.4□□□□□ -0.1
NSE3Q05541 CWP1YKL096W 720 nt14.36□□□□□ -0.11
NSE3Q05541 YLR235CYLR235C 399 nt14.35□□□□□ -0.11
NSE3Q05541 UBX6YJL048C 1191 nt14.32□□□□□ -0.12
NSE3Q05541 YKL030WYKL030W 606 nt14.32□□□□□ -0.12
NSE3Q05541 ADH2YMR303C 1047 nt14.3□□□□□ -0.12
NSE3Q05541 LCB1YMR296C 1677 nt14.23□□□□□ -0.13
NSE3Q05541 YNL195CYNL195C 786 nt14.22□□□□□ -0.13
NSE3Q05541 PCM1YEL058W 1674 nt14.2□□□□□ -0.14
NSE3Q05541 SNF6YHL025W 999 nt14.18□□□□□ -0.14
NSE3Q05541 YDR094WYDR094W 336 nt14.15□□□□□ -0.14
NSE3Q05541 DIC1YLR348C 897 nt14.13□□□□□ -0.15
NSE3Q05541 TIM23YNR017W 669 nt14.11□□□□□ -0.15
NSE3Q05541 RRT12YCR045C 1476 nt14.09□□□□□ -0.15
NSE3Q05541 RNQ1YCL028W 1218 nt14.05□□□□□ -0.16
NSE3Q05541 YSC84YHR016C 1407 nt14.05□□□□□ -0.16
NSE3Q05541 YIH1YCR059C 777 nt14.03□□□□□ -0.16
NSE3Q05541 YLR179CYLR179C 606 nt14.03□□□□□ -0.16
NSE3Q05541 YHL050CYHL050C 2094 nt13.97□□□□□ -0.17
NSE3Q05541 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.96□□□□□ -0.17
NSE3Q05541 YPR064WYPR064W 420 nt13.96□□□□□ -0.17
NSE3Q05541 SIM1YIL123W 1431 nt13.91□□□□□ -0.18
NSE3Q05541 YLL053CYLL053C 459 nt13.9□□□□□ -0.18
NSE3Q05541 BIO4YNR057C 714 nt13.9□□□□□ -0.18
NSE3Q05541 BDF1YLR399C 2061 nt13.87□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 SEC11YIR022W 504 nt13.87□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 TAD3YLR316C 969 nt13.87□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 WSC2YNL283C 1512 nt13.85□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.85□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 AHT1YHR093W 549 nt13.85□□□□□ -0.19
NSE3Q05541 FTR1YER145C 1215 nt13.82□□□□□ -0.2
NSE3Q05541 YFR018CYFR018C 1092 nt13.81□□□□□ -0.2
NSE3Q05541 AQY1YPR192W 918 nt13.8□□□□□ -0.2
NSE3Q05541 GAL1YBR020W 1587 nt13.78□□□□□ -0.2
NSE3Q05541 RRT5YFR032C 870 nt13.75□□□□□ -0.21
NSE3Q05541 PAU16YKL224C 372 nt13.75□□□□□ -0.21
NSE3Q05541 TRM5YHR070W 1500 nt13.74□□□□□ -0.21
NSE3Q05541 TAT1YBR069C 1860 nt13.72□□□□□ -0.21
NSE3Q05541 PRE6YOL038W 765 nt13.71□□□□□ -0.21
NSE3Q05541 PCH2YBR186W 1695 nt13.7□□□□□ -0.22
NSE3Q05541 ERF2YLR246W 1080 nt13.67□□□□□ -0.22
NSE3Q05541 STB1YNL309W 1263 nt13.67□□□□□ -0.22
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