Protein–RNA interactions for Protein: Q03940

RVB1, RuvB-like protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RVB1Q03940 YOR139CYOR139C 393 nt11.09□□□□□ -0.63
RVB1Q03940 EMI2YDR516C 1503 nt10.99□□□□□ -0.65
RVB1Q03940 RPP2AYOL039W 321 nt10.97□□□□□ -0.65
RVB1Q03940 PTP1YDL230W 1008 nt10.95□□□□□ -0.66
RVB1Q03940 YMR090WYMR090W 684 nt10.93□□□□□ -0.66
RVB1Q03940 SIS1YNL007C 1059 nt10.9□□□□□ -0.66
RVB1Q03940 CAC2YML102W 1407 nt10.9□□□□□ -0.66
RVB1Q03940 YDL221WYDL221W 552 nt10.88□□□□□ -0.67
RVB1Q03940 YBR220CYBR220C 1683 nt10.86□□□□□ -0.67
RVB1Q03940 YLR281CYLR281C 468 nt10.81□□□□□ -0.68
RVB1Q03940 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.8□□□□□ -0.68
RVB1Q03940 WHI5YOR083W 888 nt10.79□□□□□ -0.68
RVB1Q03940 SDH1YKL148C 1923 nt10.79□□□□□ -0.68
RVB1Q03940 YCH1YGR203W 447 nt10.77□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 IRC15YPL017C 1500 nt10.75□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 YJL152WYJL152W 360 nt10.73□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 GFD2YCL036W 1701 nt10.72□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 ART5YGR068C 1761 nt10.72□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 PUS2YGL063W 1113 nt10.71□□□□□ -0.69
RVB1Q03940 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 IMP2'YIL154C 1041 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 PET9YBL030C 957 nt10.7□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 SCC4YER147C 1875 nt10.69□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 GIS3YLR094C 1509 nt10.66□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 BOR1YNL275W 1731 nt10.66□□□□□ -0.7
RVB1Q03940 TIR4YOR009W 1464 nt10.63□□□□□ -0.71
RVB1Q03940 RTS2YOR077W 699 nt10.61□□□□□ -0.71
RVB1Q03940 GUT2YIL155C 1950 nt10.59□□□□□ -0.71
RVB1Q03940 DSK2YMR276W 1122 nt10.59□□□□□ -0.71
RVB1Q03940 PCH2YBR186W 1695 nt10.59□□□□□ -0.71
RVB1Q03940 MCH5YOR306C 1566 nt10.58□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 IDH1YNL037C 1083 nt10.58□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.56□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 YMR057CYMR057C 372 nt10.55□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 CUE1YMR264W 612 nt10.54□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 SEC11YIR022W 504 nt10.53□□□□□ -0.72
RVB1Q03940 YJL225CYJL225C 5277 nt10.51□□□□□ -0.73
RVB1Q03940 PIB2YGL023C 1908 nt10.5□□□□□ -0.73
RVB1Q03940 YSC84YHR016C 1407 nt10.45□□□□□ -0.74
RVB1Q03940 GBP2YCL011C 1284 nt10.44□□□□□ -0.74
RVB1Q03940 YLR236CYLR236C 324 nt10.43□□□□□ -0.74
RVB1Q03940 FMP45YDL222C 930 nt10.42□□□□□ -0.74
RVB1Q03940 YIL100WYIL100W 354 nt10.41□□□□□ -0.74
RVB1Q03940 YHL050CYHL050C 2094 nt10.38□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 YDR433WYDR433W 441 nt10.37□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 TCD2YKL027W 1344 nt10.36□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 YNL195CYNL195C 786 nt10.36□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 RRT12YCR045C 1476 nt10.35□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 MOT3YMR070W 1473 nt10.35□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 ERV46YAL042W 1248 nt10.34□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 YPR011CYPR011C 981 nt10.34□□□□□ -0.75
RVB1Q03940 RPM1RPM1 483 nt10.31□□□□□ -0.76
RVB1Q03940 YKR040CYKR040C 504 nt10.29□□□□□ -0.76
RVB1Q03940 LPX1YOR084W 1164 nt10.26□□□□□ -0.77
RVB1Q03940 RTF1YGL244W 1677 nt10.23□□□□□ -0.77
RVB1Q03940 FMP52YER004W 696 nt10.23□□□□□ -0.77
RVB1Q03940 ALG12YNR030W 1656 nt10.22□□□□□ -0.77
RVB1Q03940 RRD1YIL153W 1182 nt10.2□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 BOP3YNL042W 1191 nt10.2□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 MXR2YCL033C 507 nt10.18□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 YCL042WYCL042W 360 nt10.18□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 PTK1YKL198C 1989 nt10.17□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 DED1YOR204W 1815 nt10.15□□□□□ -0.78
RVB1Q03940 SOR2YDL246C 1074 nt10.09□□□□□ -0.79
RVB1Q03940 SOR1YJR159W 1074 nt10.09□□□□□ -0.79
RVB1Q03940 NCP1YHR042W 2076 nt10.09□□□□□ -0.79
RVB1Q03940 CWP1YKL096W 720 nt10.05□□□□□ -0.8
RVB1Q03940 FMT1YBL013W 1206 nt10.04□□□□□ -0.8
RVB1Q03940 FRD1YEL047C 1413 nt10.04□□□□□ -0.8
RVB1Q03940 SNF6YHL025W 999 nt10.02□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 PCM1YEL058W 1674 nt10.02□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 LCB1YMR296C 1677 nt10.02□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 YLR235CYLR235C 399 nt9.98□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 ADH2YMR303C 1047 nt9.98□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 SPP1YPL138C 1062 nt9.98□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 MRPL8YJL063C 717 nt9.97□□□□□ -0.81
RVB1Q03940 HSP60YLR259C 1719 nt9.93□□□□□ -0.82
RVB1Q03940 SIM1YIL123W 1431 nt9.92□□□□□ -0.82
RVB1Q03940 ADO1YJR105W 1023 nt9.92□□□□□ -0.82
RVB1Q03940 NAR1YNL240C 1476 nt9.91□□□□□ -0.82
RVB1Q03940 RNQ1YCL028W 1218 nt9.88□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YFL054CYFL054C 1941 nt9.88□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YIH1YCR059C 777 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YEL076CYEL076C 651 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 PTH1YHR189W 573 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YKL030WYKL030W 606 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 YLR464WYLR464W 651 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 BIO4YNR057C 714 nt9.87□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 DIC1YLR348C 897 nt9.86□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 SPT8YLR055C 1809 nt9.84□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 RTG1YOL067C 534 nt9.84□□□□□ -0.83
RVB1Q03940 HUA1YGR268C 597 nt9.82□□□□□ -0.84
RVB1Q03940 TIM23YNR017W 669 nt9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms