Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 SIS1YNL007C 1059 nt12.12□□□□□ -0.47
CCE1Q03702 RPP2AYOL039W 321 nt12.1□□□□□ -0.47
CCE1Q03702 YJL152WYJL152W 360 nt12.06□□□□□ -0.48
CCE1Q03702 SPT5YML010W 3192 nt12.04□□□□□ -0.48
CCE1Q03702 IMP2'YIL154C 1041 nt12.03□□□□□ -0.48
CCE1Q03702 YCH1YGR203W 447 nt11.96□□□□□ -0.49
CCE1Q03702 DSK2YMR276W 1122 nt11.95□□□□□ -0.5
CCE1Q03702 PTP1YDL230W 1008 nt11.92□□□□□ -0.5
CCE1Q03702 PET9YBL030C 957 nt11.9□□□□□ -0.5
CCE1Q03702 TIR4YOR009W 1464 nt11.89□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 ART5YGR068C 1761 nt11.89□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 IDH1YNL037C 1083 nt11.88□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 DCW1YKL046C 1350 nt11.88□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 YMR090WYMR090W 684 nt11.86□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 FMP45YDL222C 930 nt11.85□□□□□ -0.51
CCE1Q03702 EMI2YDR516C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 GFD2YCL036W 1701 nt11.81□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.81□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 CAC2YML102W 1407 nt11.79□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 YLR236CYLR236C 324 nt11.79□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 YMR057CYMR057C 372 nt11.79□□□□□ -0.52
CCE1Q03702 YPR011CYPR011C 981 nt11.76□□□□□ -0.53
CCE1Q03702 GBP2YCL011C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
CCE1Q03702 MOT3YMR070W 1473 nt11.75□□□□□ -0.53
CCE1Q03702 YDL221WYDL221W 552 nt11.73□□□□□ -0.53
CCE1Q03702 YDR433WYDR433W 441 nt11.71□□□□□ -0.53
CCE1Q03702 SSA4YER103W 1929 nt11.69□□□□□ -0.54
CCE1Q03702 RTS2YOR077W 699 nt11.67□□□□□ -0.54
CCE1Q03702 ERV46YAL042W 1248 nt11.65□□□□□ -0.54
CCE1Q03702 LPX1YOR084W 1164 nt11.63□□□□□ -0.55
CCE1Q03702 IRC15YPL017C 1500 nt11.63□□□□□ -0.55
CCE1Q03702 TCD2YKL027W 1344 nt11.61□□□□□ -0.55
CCE1Q03702 CUE1YMR264W 612 nt11.61□□□□□ -0.55
CCE1Q03702 YKR040CYKR040C 504 nt11.6□□□□□ -0.55
CCE1Q03702 GIS3YLR094C 1509 nt11.56□□□□□ -0.56
CCE1Q03702 FPS1YLL043W 2010 nt11.55□□□□□ -0.56
CCE1Q03702 YIL100WYIL100W 354 nt11.55□□□□□ -0.56
CCE1Q03702 SDH1YKL148C 1923 nt11.54□□□□□ -0.56
CCE1Q03702 SCC4YER147C 1875 nt11.52□□□□□ -0.57
CCE1Q03702 MXR2YCL033C 507 nt11.51□□□□□ -0.57
CCE1Q03702 YBR220CYBR220C 1683 nt11.49□□□□□ -0.57
CCE1Q03702 RRD1YIL153W 1182 nt11.43□□□□□ -0.58
CCE1Q03702 YNL195CYNL195C 786 nt11.41□□□□□ -0.58
CCE1Q03702 YCL042WYCL042W 360 nt11.41□□□□□ -0.58
CCE1Q03702 FMP52YER004W 696 nt11.39□□□□□ -0.59
CCE1Q03702 SPP1YPL138C 1062 nt11.38□□□□□ -0.59
CCE1Q03702 DED1YOR204W 1815 nt11.37□□□□□ -0.59
CCE1Q03702 MRPL8YJL063C 717 nt11.36□□□□□ -0.59
CCE1Q03702 FRD1YEL047C 1413 nt11.3□□□□□ -0.6
CCE1Q03702 ADO1YJR105W 1023 nt11.3□□□□□ -0.6
CCE1Q03702 SOR2YDL246C 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
CCE1Q03702 SOR1YJR159W 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
CCE1Q03702 CWP1YKL096W 720 nt11.27□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 FMT1YBL013W 1206 nt11.27□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.24□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 YEL076CYEL076C 651 nt11.24□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 YLR464WYLR464W 651 nt11.24□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 YLR235CYLR235C 399 nt11.22□□□□□ -0.61
CCE1Q03702 ADH2YMR303C 1047 nt11.2□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 RTG1YOL067C 534 nt11.2□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 YSC84YHR016C 1407 nt11.19□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 SNF6YHL025W 999 nt11.19□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 PCM1YEL058W 1674 nt11.17□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 PTH1YHR189W 573 nt11.17□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 RRT12YCR045C 1476 nt11.16□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 HUA1YGR268C 597 nt11.15□□□□□ -0.62
CCE1Q03702 YKL030WYKL030W 606 nt11.14□□□□□ -0.63
CCE1Q03702 BDF1YLR399C 2061 nt11.12□□□□□ -0.63
CCE1Q03702 YHL050CYHL050C 2094 nt11.08□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 DIC1YLR348C 897 nt11.06□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 RNQ1YCL028W 1218 nt11.04□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 YIH1YCR059C 777 nt11.03□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 LCB1YMR296C 1677 nt11.03□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 SIM1YIL123W 1431 nt11.02□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 TAT1YBR069C 1860 nt11.02□□□□□ -0.64
CCE1Q03702 TIM23YNR017W 669 nt11.02□□□□□ -0.65
CCE1Q03702 PCH2YBR186W 1695 nt11□□□□□ -0.65
CCE1Q03702 YLR179CYLR179C 606 nt10.98□□□□□ -0.65
CCE1Q03702 BIO4YNR057C 714 nt10.94□□□□□ -0.66
CCE1Q03702 YLL053CYLL053C 459 nt10.93□□□□□ -0.66
CCE1Q03702 YPR064WYPR064W 420 nt10.93□□□□□ -0.66
CCE1Q03702 YJL225CYJL225C 5277 nt10.91□□□□□ -0.66
CCE1Q03702 AQY1YPR192W 918 nt10.9□□□□□ -0.66
CCE1Q03702 GUT2YIL155C 1950 nt10.89□□□□□ -0.67
CCE1Q03702 FTR1YER145C 1215 nt10.87□□□□□ -0.67
CCE1Q03702 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.86□□□□□ -0.67
CCE1Q03702 BOP3YNL042W 1191 nt10.86□□□□□ -0.67
CCE1Q03702 ERF2YLR246W 1080 nt10.85□□□□□ -0.67
CCE1Q03702 TAD3YLR316C 969 nt10.83□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 DDR2YOL052C-A 186 nt10.82□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 GAL1YBR020W 1587 nt10.82□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 YDR094WYDR094W 336 nt10.81□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 YFL067WYFL067W 528 nt10.81□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 RTF1YGL244W 1677 nt10.8□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 AHT1YHR093W 549 nt10.8□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 UBX6YJL048C 1191 nt10.8□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 TRM5YHR070W 1500 nt10.79□□□□□ -0.68
CCE1Q03702 WSC2YNL283C 1512 nt10.76□□□□□ -0.69
CCE1Q03702 STB1YNL309W 1263 nt10.75□□□□□ -0.69
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