Protein–RNA interactions for Protein: P53297

PBP1, PAB1-binding protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PBP1P53297 ALF1YNL148C 765 nt11.11□□□□□ -0.63
PBP1P53297 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
PBP1P53297 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.09□□□□□ -0.63
PBP1P53297 TAT1YBR069C 1860 nt11.08□□□□□ -0.64
PBP1P53297 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.06□□□□□ -0.64
PBP1P53297 YPS1YLR120C 1710 nt11.04□□□□□ -0.64
PBP1P53297 YDR095CYDR095C 411 nt11.02□□□□□ -0.65
PBP1P53297 DSK2YMR276W 1122 nt11.01□□□□□ -0.65
PBP1P53297 MEP2YNL142W 1500 nt11□□□□□ -0.65
PBP1P53297 IMP2'YIL154C 1041 nt11□□□□□ -0.65
PBP1P53297 YJL225CYJL225C 5277 nt10.98□□□□□ -0.65
PBP1P53297 FMP45YDL222C 930 nt10.97□□□□□ -0.65
PBP1P53297 YLR236CYLR236C 324 nt10.96□□□□□ -0.65
PBP1P53297 YPR011CYPR011C 981 nt10.96□□□□□ -0.65
PBP1P53297 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.92□□□□□ -0.66
PBP1P53297 YJL152WYJL152W 360 nt10.92□□□□□ -0.66
PBP1P53297 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.91□□□□□ -0.66
PBP1P53297 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.91□□□□□ -0.66
PBP1P53297 SIS1YNL007C 1059 nt10.91□□□□□ -0.66
PBP1P53297 YCH1YGR203W 447 nt10.86□□□□□ -0.67
PBP1P53297 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
PBP1P53297 RPP2AYOL039W 321 nt10.81□□□□□ -0.68
PBP1P53297 TIR4YOR009W 1464 nt10.81□□□□□ -0.68
PBP1P53297 LPX1YOR084W 1164 nt10.76□□□□□ -0.69
PBP1P53297 ERV46YAL042W 1248 nt10.75□□□□□ -0.69
PBP1P53297 DCW1YKL046C 1350 nt10.75□□□□□ -0.69
PBP1P53297 PTP1YDL230W 1008 nt10.73□□□□□ -0.69
PBP1P53297 YDR433WYDR433W 441 nt10.71□□□□□ -0.69
PBP1P53297 ART5YGR068C 1761 nt10.7□□□□□ -0.7
PBP1P53297 PET9YBL030C 957 nt10.69□□□□□ -0.7
PBP1P53297 YMR090WYMR090W 684 nt10.69□□□□□ -0.7
PBP1P53297 GBP2YCL011C 1284 nt10.68□□□□□ -0.7
PBP1P53297 MRPL8YJL063C 717 nt10.67□□□□□ -0.7
PBP1P53297 EMI2YDR516C 1503 nt10.67□□□□□ -0.7
PBP1P53297 CAC2YML102W 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
PBP1P53297 YMR057CYMR057C 372 nt10.65□□□□□ -0.7
PBP1P53297 GFD2YCL036W 1701 nt10.64□□□□□ -0.71
PBP1P53297 YKR040CYKR040C 504 nt10.64□□□□□ -0.71
PBP1P53297 UME6YDR207C 2511 nt10.63□□□□□ -0.71
PBP1P53297 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.63□□□□□ -0.71
PBP1P53297 SPP1YPL138C 1062 nt10.62□□□□□ -0.71
PBP1P53297 YBR220CYBR220C 1683 nt10.61□□□□□ -0.71
PBP1P53297 YDL221WYDL221W 552 nt10.6□□□□□ -0.71
PBP1P53297 RPM1RPM1 483 nt10.6□□□□□ -0.71
PBP1P53297 MXR2YCL033C 507 nt10.58□□□□□ -0.72
PBP1P53297 FRE6YLL051C 2139 nt10.55□□□□□ -0.72
PBP1P53297 ADO1YJR105W 1023 nt10.54□□□□□ -0.72
PBP1P53297 TCD2YKL027W 1344 nt10.54□□□□□ -0.72
PBP1P53297 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.53□□□□□ -0.72
PBP1P53297 YEL076CYEL076C 651 nt10.53□□□□□ -0.72
PBP1P53297 YLR464WYLR464W 651 nt10.53□□□□□ -0.72
PBP1P53297 RTG1YOL067C 534 nt10.51□□□□□ -0.73
PBP1P53297 SDH1YKL148C 1923 nt10.5□□□□□ -0.73
PBP1P53297 YGR139WYGR139W 339 nt10.49□□□□□ -0.73
PBP1P53297 RTS2YOR077W 699 nt10.49□□□□□ -0.73
PBP1P53297 NME1NME1 340 nt10.48□□□□□ -0.73
PBP1P53297 IRC15YPL017C 1500 nt10.44□□□□□ -0.74
PBP1P53297 RRD1YIL153W 1182 nt10.43□□□□□ -0.74
PBP1P53297 DED1YOR204W 1815 nt10.42□□□□□ -0.74
PBP1P53297 CUE1YMR264W 612 nt10.41□□□□□ -0.74
PBP1P53297 SCC4YER147C 1875 nt10.4□□□□□ -0.75
PBP1P53297 FRD1YEL047C 1413 nt10.39□□□□□ -0.75
PBP1P53297 GIS3YLR094C 1509 nt10.37□□□□□ -0.75
PBP1P53297 HUA1YGR268C 597 nt10.34□□□□□ -0.75
PBP1P53297 SEC11YIR022W 504 nt10.34□□□□□ -0.75
PBP1P53297 YCL042WYCL042W 360 nt10.34□□□□□ -0.75
PBP1P53297 SOR2YDL246C 1074 nt10.31□□□□□ -0.76
PBP1P53297 SOR1YJR159W 1074 nt10.31□□□□□ -0.76
PBP1P53297 FMT1YBL013W 1206 nt10.31□□□□□ -0.76
PBP1P53297 UBX6YJL048C 1191 nt10.3□□□□□ -0.76
PBP1P53297 PCH2YBR186W 1695 nt10.29□□□□□ -0.76
PBP1P53297 YIL100WYIL100W 354 nt10.29□□□□□ -0.76
PBP1P53297 FMP52YER004W 696 nt10.27□□□□□ -0.77
PBP1P53297 PTH1YHR189W 573 nt10.27□□□□□ -0.77
PBP1P53297 GUT2YIL155C 1950 nt10.26□□□□□ -0.77
PBP1P53297 YLR235CYLR235C 399 nt10.25□□□□□ -0.77
PBP1P53297 YKL030WYKL030W 606 nt10.23□□□□□ -0.77
PBP1P53297 BOR1YNL275W 1731 nt10.22□□□□□ -0.77
PBP1P53297 CWP1YKL096W 720 nt10.21□□□□□ -0.77
PBP1P53297 YDR094WYDR094W 336 nt10.17□□□□□ -0.78
PBP1P53297 ADH2YMR303C 1047 nt10.17□□□□□ -0.78
PBP1P53297 LCB1YMR296C 1677 nt10.15□□□□□ -0.78
PBP1P53297 MCH5YOR306C 1566 nt10.14□□□□□ -0.79
PBP1P53297 YNL195CYNL195C 786 nt10.13□□□□□ -0.79
PBP1P53297 YSC84YHR016C 1407 nt10.13□□□□□ -0.79
PBP1P53297 PIB2YGL023C 1908 nt10.11□□□□□ -0.79
PBP1P53297 YHL050CYHL050C 2094 nt10.11□□□□□ -0.79
PBP1P53297 PCM1YEL058W 1674 nt10.09□□□□□ -0.79
PBP1P53297 SNF6YHL025W 999 nt10.09□□□□□ -0.79
PBP1P53297 DIC1YLR348C 897 nt10.07□□□□□ -0.8
PBP1P53297 TIM23YNR017W 669 nt10.07□□□□□ -0.8
PBP1P53297 RTF1YGL244W 1677 nt10.02□□□□□ -0.81
PBP1P53297 RNQ1YCL028W 1218 nt10.01□□□□□ -0.81
PBP1P53297 RRT12YCR045C 1476 nt10.01□□□□□ -0.81
PBP1P53297 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10□□□□□ -0.81
PBP1P53297 YLR179CYLR179C 606 nt10□□□□□ -0.81
PBP1P53297 YIH1YCR059C 777 nt9.99□□□□□ -0.81
PBP1P53297 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.97□□□□□ -0.81
PBP1P53297 BOP3YNL042W 1191 nt9.97□□□□□ -0.81
PBP1P53297 YPR064WYPR064W 420 nt9.96□□□□□ -0.82
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