Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.01□□□□□ -0.49
KXD1P53158 MEP2YNL142W 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
KXD1P53158 BUR6YER159C 429 nt11.93□□□□□ -0.5
KXD1P53158 SIS1YNL007C 1059 nt11.92□□□□□ -0.5
KXD1P53158 YLR281CYLR281C 468 nt11.9□□□□□ -0.5
KXD1P53158 RPP2AYOL039W 321 nt11.87□□□□□ -0.51
KXD1P53158 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 WHI5YOR083W 888 nt11.85□□□□□ -0.51
KXD1P53158 PTP1YDL230W 1008 nt11.84□□□□□ -0.51
KXD1P53158 BMT5YIL096C 1011 nt11.83□□□□□ -0.52
KXD1P53158 SSA4YER103W 1929 nt11.82□□□□□ -0.52
KXD1P53158 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.81□□□□□ -0.52
KXD1P53158 DCW1YKL046C 1350 nt11.8□□□□□ -0.52
KXD1P53158 Q0010Q0010 387 nt11.8□□□□□ -0.52
KXD1P53158 MET8YBR213W 825 nt11.76□□□□□ -0.53
KXD1P53158 PUS2YGL063W 1113 nt11.75□□□□□ -0.53
KXD1P53158 ARA2YMR041C 1008 nt11.72□□□□□ -0.53
KXD1P53158 CAC2YML102W 1407 nt11.71□□□□□ -0.53
KXD1P53158 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
KXD1P53158 ART5YGR068C 1761 nt11.69□□□□□ -0.54
KXD1P53158 YDR509WYDR509W 348 nt11.69□□□□□ -0.54
KXD1P53158 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.69□□□□□ -0.54
KXD1P53158 EMI2YDR516C 1503 nt11.67□□□□□ -0.54
KXD1P53158 YCH1YGR203W 447 nt11.67□□□□□ -0.54
KXD1P53158 PET9YBL030C 957 nt11.67□□□□□ -0.54
KXD1P53158 YJL152WYJL152W 360 nt11.66□□□□□ -0.54
KXD1P53158 GFD2YCL036W 1701 nt11.66□□□□□ -0.54
KXD1P53158 IMP2'YIL154C 1041 nt11.62□□□□□ -0.55
KXD1P53158 FPS1YLL043W 2010 nt11.61□□□□□ -0.55
KXD1P53158 SRN2YLR119W 642 nt11.61□□□□□ -0.55
KXD1P53158 YDL221WYDL221W 552 nt11.6□□□□□ -0.55
KXD1P53158 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.6□□□□□ -0.55
KXD1P53158 DSK2YMR276W 1122 nt11.6□□□□□ -0.55
KXD1P53158 YLR122CYLR122C 378 nt11.58□□□□□ -0.56
KXD1P53158 YMR090WYMR090W 684 nt11.58□□□□□ -0.56
KXD1P53158 CLB6YGR109C 1143 nt11.57□□□□□ -0.56
KXD1P53158 YLR236CYLR236C 324 nt11.56□□□□□ -0.56
KXD1P53158 YPR011CYPR011C 981 nt11.56□□□□□ -0.56
KXD1P53158 YMR057CYMR057C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
KXD1P53158 IRC15YPL017C 1500 nt11.55□□□□□ -0.56
KXD1P53158 Q0144Q0144 330 nt11.51□□□□□ -0.57
KXD1P53158 ABZ2YMR289W 1125 nt11.51□□□□□ -0.57
KXD1P53158 IDH1YNL037C 1083 nt11.5□□□□□ -0.57
KXD1P53158 RTS2YOR077W 699 nt11.47□□□□□ -0.57
KXD1P53158 FMP45YDL222C 930 nt11.45□□□□□ -0.58
KXD1P53158 YBR220CYBR220C 1683 nt11.45□□□□□ -0.58
KXD1P53158 GIS3YLR094C 1509 nt11.45□□□□□ -0.58
KXD1P53158 SDH1YKL148C 1923 nt11.45□□□□□ -0.58
KXD1P53158 SEM1YDR363W-A 270 nt11.44□□□□□ -0.58
KXD1P53158 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.44□□□□□ -0.58
KXD1P53158 CUE1YMR264W 612 nt11.42□□□□□ -0.58
KXD1P53158 GBP2YCL011C 1284 nt11.4□□□□□ -0.58
KXD1P53158 ERV46YAL042W 1248 nt11.39□□□□□ -0.59
KXD1P53158 BDF1YLR399C 2061 nt11.39□□□□□ -0.59
KXD1P53158 SCC4YER147C 1875 nt11.38□□□□□ -0.59
KXD1P53158 VAR1Q0140 1197 nt11.38□□□□□ -0.59
KXD1P53158 LPX1YOR084W 1164 nt11.35□□□□□ -0.59
KXD1P53158 YDR433WYDR433W 441 nt11.33□□□□□ -0.6
KXD1P53158 ARP10YDR106W 855 nt11.32□□□□□ -0.6
KXD1P53158 YKR040CYKR040C 504 nt11.28□□□□□ -0.6
KXD1P53158 LCP5YER127W 1074 nt11.27□□□□□ -0.61
KXD1P53158 RRD1YIL153W 1182 nt11.27□□□□□ -0.61
KXD1P53158 TCD2YKL027W 1344 nt11.27□□□□□ -0.61
KXD1P53158 TOM20YGR082W 552 nt11.26□□□□□ -0.61
KXD1P53158 YIL100WYIL100W 354 nt11.25□□□□□ -0.61
KXD1P53158 MXR2YCL033C 507 nt11.25□□□□□ -0.61
KXD1P53158 DED1YOR204W 1815 nt11.25□□□□□ -0.61
KXD1P53158 TAT1YBR069C 1860 nt11.23□□□□□ -0.61
KXD1P53158 URH1YDR400W 1023 nt11.15□□□□□ -0.62
KXD1P53158 FMT1YBL013W 1206 nt11.14□□□□□ -0.63
KXD1P53158 FMP52YER004W 696 nt11.13□□□□□ -0.63
KXD1P53158 SPP1YPL138C 1062 nt11.13□□□□□ -0.63
KXD1P53158 FRD1YEL047C 1413 nt11.1□□□□□ -0.63
KXD1P53158 UTP6YDR449C 1323 nt11.09□□□□□ -0.63
KXD1P53158 SOR2YDL246C 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
KXD1P53158 SOR1YJR159W 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
KXD1P53158 YNL195CYNL195C 786 nt11.08□□□□□ -0.64
KXD1P53158 YSC84YHR016C 1407 nt11.08□□□□□ -0.64
KXD1P53158 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.07□□□□□ -0.64
KXD1P53158 PET20YPL159C 762 nt11.06□□□□□ -0.64
KXD1P53158 RRT12YCR045C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
KXD1P53158 YHL050CYHL050C 2094 nt11.05□□□□□ -0.64
KXD1P53158 SEC11YIR022W 504 nt11.04□□□□□ -0.64
KXD1P53158 YCL042WYCL042W 360 nt11.04□□□□□ -0.64
KXD1P53158 NVJ2YPR091C 2313 nt11.01□□□□□ -0.65
KXD1P53158 CWP1YKL096W 720 nt11□□□□□ -0.65
KXD1P53158 ADH2YMR303C 1047 nt10.99□□□□□ -0.65
KXD1P53158 YCR099CYCR099C 468 nt10.98□□□□□ -0.65
KXD1P53158 YJL118WYJL118W 660 nt10.98□□□□□ -0.65
KXD1P53158 PCM1YEL058W 1674 nt10.98□□□□□ -0.65
KXD1P53158 MRPL8YJL063C 717 nt10.97□□□□□ -0.65
KXD1P53158 RPM1RPM1 483 nt10.97□□□□□ -0.65
KXD1P53158 RTG1YOL067C 534 nt10.96□□□□□ -0.65
KXD1P53158 PAC11YDR488C 1602 nt10.95□□□□□ -0.66
KXD1P53158 HMT1YBR034C 1047 nt10.95□□□□□ -0.66
KXD1P53158 YPL071CYPL071C 471 nt10.95□□□□□ -0.66
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