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Protein–RNA interactions for Protein: P41834
UFE1, Syntaxin UFE1, yeast
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346 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
UFE1
P41834
MOT3
YMR070W
1473 nt
12.57
□□□□□ -0.4
UFE1
P41834
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
12.55
□□□□□ -0.4
UFE1
P41834
SIS1
YNL007C
1059 nt
12.54
□□□□□ -0.4
UFE1
P41834
YLR236C
YLR236C
324 nt
12.52
□□□□□ -0.41
UFE1
P41834
YPR011C
YPR011C
981 nt
12.52
□□□□□ -0.41
UFE1
P41834
FMP45
YDL222C
930 nt
12.51
□□□□□ -0.41
UFE1
P41834
YJL152W
YJL152W
360 nt
12.48
□□□□□ -0.41
UFE1
P41834
RPP2A
YOL039W
321 nt
12.44
□□□□□ -0.42
UFE1
P41834
SPT5
YML010W
3192 nt
12.42
□□□□□ -0.42
UFE1
P41834
YCH1
YGR203W
447 nt
12.41
□□□□□ -0.42
UFE1
P41834
MEP2
YNL142W
1500 nt
12.41
□□□□□ -0.42
UFE1
P41834
TIR4
YOR009W
1464 nt
12.39
□□□□□ -0.43
UFE1
P41834
IDH1
YNL037C
1083 nt
12.37
□□□□□ -0.43
UFE1
P41834
PTP1
YDL230W
1008 nt
12.34
□□□□□ -0.43
UFE1
P41834
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YAL042W
1248 nt
12.31
□□□□□ -0.44
UFE1
P41834
ART5
YGR068C
1761 nt
12.3
□□□□□ -0.44
UFE1
P41834
LPX1
YOR084W
1164 nt
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□□□□□ -0.44
UFE1
P41834
PET9
YBL030C
957 nt
12.28
□□□□□ -0.44
UFE1
P41834
CAC2
YML102W
1407 nt
12.23
□□□□□ -0.45
UFE1
P41834
YDR433W
YDR433W
441 nt
12.23
□□□□□ -0.45
UFE1
P41834
GFD2
YCL036W
1701 nt
12.23
□□□□□ -0.45
UFE1
P41834
GBP2
YCL011C
1284 nt
12.22
□□□□□ -0.45
UFE1
P41834
YMR057C
YMR057C
372 nt
12.2
□□□□□ -0.46
UFE1
P41834
DCW1
YKL046C
1350 nt
12.19
□□□□□ -0.46
UFE1
P41834
MRPL8
YJL063C
717 nt
12.19
□□□□□ -0.46
UFE1
P41834
YKR040C
YKR040C
504 nt
12.18
□□□□□ -0.46
UFE1
P41834
YCL048W-A
YCL048W-A
240 nt
12.18
□□□□□ -0.46
UFE1
P41834
SPP1
YPL138C
1062 nt
12.12
□□□□□ -0.47
UFE1
P41834
MXR2
YCL033C
507 nt
12.1
□□□□□ -0.47
UFE1
P41834
EMI2
YDR516C
1503 nt
12.08
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
TCD2
YKL027W
1344 nt
12.07
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
YDL221W
YDL221W
552 nt
12.03
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
ADO1
YJR105W
1023 nt
12.03
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
RTS2
YOR077W
699 nt
12.03
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
FPS1
YLL043W
2010 nt
12.03
□□□□□ -0.48
UFE1
P41834
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YEL076C-A
651 nt
12.02
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
YEL076C
YEL076C
651 nt
12.02
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
YLR464W
YLR464W
651 nt
12.02
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
IRC15
YPL017C
1500 nt
12.01
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
YMR090W
YMR090W
684 nt
12
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
RTG1
YOL067C
534 nt
12
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
RRD1
YIL153W
1182 nt
11.96
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
CUE1
YMR264W
612 nt
11.96
□□□□□ -0.49
UFE1
P41834
DED1
YOR204W
1815 nt
11.95
□□□□□ -0.5
UFE1
P41834
GIS3
YLR094C
1509 nt
11.91
□□□□□ -0.5
UFE1
P41834
FRD1
YEL047C
1413 nt
11.9
□□□□□ -0.5
UFE1
P41834
SSA4
YER103W
1929 nt
11.86
□□□□□ -0.51
UFE1
P41834
YCL042W
YCL042W
360 nt
11.84
□□□□□ -0.51
UFE1
P41834
SOR2
YDL246C
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11.83
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
SOR1
YJR159W
1074 nt
11.83
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
FMT1
YBL013W
1206 nt
11.82
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
SDH1
YKL148C
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11.82
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
YIL100W
YIL100W
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11.81
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
FMP52
YER004W
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□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
HUA1
YGR268C
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11.8
□□□□□ -0.52
UFE1
P41834
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YER147C
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UFE1
P41834
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YBR220C
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UFE1
P41834
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YLR235C
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□□□□□ -0.53
UFE1
P41834
PTH1
YHR189W
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UFE1
P41834
UBX6
YJL048C
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□□□□□ -0.53
UFE1
P41834
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YKL030W
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11.7
□□□□□ -0.54
UFE1
P41834
CWP1
YKL096W
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UFE1
P41834
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YMR303C
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□□□□□ -0.54
UFE1
P41834
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YMR296C
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□□□□□ -0.55
UFE1
P41834
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YDR094W
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□□□□□ -0.55
UFE1
P41834
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YDR488C
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UFE1
P41834
PCM1
YEL058W
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□□□□□ -0.55
UFE1
P41834
SNF6
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UFE1
P41834
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YNL195C
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□□□□□ -0.56
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.56
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.56
UFE1
P41834
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UFE1
P41834
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UFE1
P41834
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UFE1
P41834
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UFE1
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UFE1
P41834
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YLR179C
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UFE1
P41834
tL(GAG)G
tL(GAG)G
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UFE1
P41834
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YHL050C
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□□□□□ -0.58
UFE1
P41834
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YPR064W
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UFE1
P41834
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YFL015W-A
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UFE1
P41834
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P41834
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UFE1
P41834
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P41834
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YLL053C
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□□□□□ -0.59
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.59
UFE1
P41834
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YFR018C
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□□□□□ -0.6
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.6
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.6
UFE1
P41834
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□□□□□ -0.6
UFE1
P41834
GAL1
YBR020W
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11.25
□□□□□ -0.61
UFE1
P41834
PAU16
YKL224C
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11.25
□□□□□ -0.61
UFE1
P41834
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YFR032C
870 nt
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□□□□□ -0.61
UFE1
P41834
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YBR069C
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□□□□□ -0.61
UFE1
P41834
TRM5
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11.2
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
PRE6
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11.2
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
PCH2
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11.18
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
ERF2
YLR246W
1080 nt
11.18
□□□□□ -0.62
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