Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 MOT3YMR070W 1473 nt12.57□□□□□ -0.4
UFE1P41834 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.55□□□□□ -0.4
UFE1P41834 SIS1YNL007C 1059 nt12.54□□□□□ -0.4
UFE1P41834 YLR236CYLR236C 324 nt12.52□□□□□ -0.41
UFE1P41834 YPR011CYPR011C 981 nt12.52□□□□□ -0.41
UFE1P41834 FMP45YDL222C 930 nt12.51□□□□□ -0.41
UFE1P41834 YJL152WYJL152W 360 nt12.48□□□□□ -0.41
UFE1P41834 RPP2AYOL039W 321 nt12.44□□□□□ -0.42
UFE1P41834 SPT5YML010W 3192 nt12.42□□□□□ -0.42
UFE1P41834 YCH1YGR203W 447 nt12.41□□□□□ -0.42
UFE1P41834 MEP2YNL142W 1500 nt12.41□□□□□ -0.42
UFE1P41834 TIR4YOR009W 1464 nt12.39□□□□□ -0.43
UFE1P41834 IDH1YNL037C 1083 nt12.37□□□□□ -0.43
UFE1P41834 PTP1YDL230W 1008 nt12.34□□□□□ -0.43
UFE1P41834 ERV46YAL042W 1248 nt12.31□□□□□ -0.44
UFE1P41834 ART5YGR068C 1761 nt12.3□□□□□ -0.44
UFE1P41834 LPX1YOR084W 1164 nt12.29□□□□□ -0.44
UFE1P41834 PET9YBL030C 957 nt12.28□□□□□ -0.44
UFE1P41834 CAC2YML102W 1407 nt12.23□□□□□ -0.45
UFE1P41834 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
UFE1P41834 GFD2YCL036W 1701 nt12.23□□□□□ -0.45
UFE1P41834 GBP2YCL011C 1284 nt12.22□□□□□ -0.45
UFE1P41834 YMR057CYMR057C 372 nt12.2□□□□□ -0.46
UFE1P41834 DCW1YKL046C 1350 nt12.19□□□□□ -0.46
UFE1P41834 MRPL8YJL063C 717 nt12.19□□□□□ -0.46
UFE1P41834 YKR040CYKR040C 504 nt12.18□□□□□ -0.46
UFE1P41834 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.18□□□□□ -0.46
UFE1P41834 SPP1YPL138C 1062 nt12.12□□□□□ -0.47
UFE1P41834 MXR2YCL033C 507 nt12.1□□□□□ -0.47
UFE1P41834 EMI2YDR516C 1503 nt12.08□□□□□ -0.48
UFE1P41834 TCD2YKL027W 1344 nt12.07□□□□□ -0.48
UFE1P41834 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
UFE1P41834 ADO1YJR105W 1023 nt12.03□□□□□ -0.48
UFE1P41834 RTS2YOR077W 699 nt12.03□□□□□ -0.48
UFE1P41834 FPS1YLL043W 2010 nt12.03□□□□□ -0.48
UFE1P41834 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.02□□□□□ -0.49
UFE1P41834 YEL076CYEL076C 651 nt12.02□□□□□ -0.49
UFE1P41834 YLR464WYLR464W 651 nt12.02□□□□□ -0.49
UFE1P41834 IRC15YPL017C 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
UFE1P41834 YMR090WYMR090W 684 nt12□□□□□ -0.49
UFE1P41834 RTG1YOL067C 534 nt12□□□□□ -0.49
UFE1P41834 RRD1YIL153W 1182 nt11.96□□□□□ -0.49
UFE1P41834 CUE1YMR264W 612 nt11.96□□□□□ -0.49
UFE1P41834 DED1YOR204W 1815 nt11.95□□□□□ -0.5
UFE1P41834 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
UFE1P41834 FRD1YEL047C 1413 nt11.9□□□□□ -0.5
UFE1P41834 SSA4YER103W 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
UFE1P41834 YCL042WYCL042W 360 nt11.84□□□□□ -0.51
UFE1P41834 SOR2YDL246C 1074 nt11.83□□□□□ -0.52
UFE1P41834 SOR1YJR159W 1074 nt11.83□□□□□ -0.52
UFE1P41834 FMT1YBL013W 1206 nt11.82□□□□□ -0.52
UFE1P41834 SDH1YKL148C 1923 nt11.82□□□□□ -0.52
UFE1P41834 YIL100WYIL100W 354 nt11.81□□□□□ -0.52
UFE1P41834 FMP52YER004W 696 nt11.8□□□□□ -0.52
UFE1P41834 HUA1YGR268C 597 nt11.8□□□□□ -0.52
UFE1P41834 SCC4YER147C 1875 nt11.79□□□□□ -0.52
UFE1P41834 YBR220CYBR220C 1683 nt11.75□□□□□ -0.53
UFE1P41834 YLR235CYLR235C 399 nt11.74□□□□□ -0.53
UFE1P41834 PTH1YHR189W 573 nt11.73□□□□□ -0.53
UFE1P41834 UBX6YJL048C 1191 nt11.71□□□□□ -0.53
UFE1P41834 YKL030WYKL030W 606 nt11.7□□□□□ -0.54
UFE1P41834 CWP1YKL096W 720 nt11.69□□□□□ -0.54
UFE1P41834 ADH2YMR303C 1047 nt11.65□□□□□ -0.54
UFE1P41834 LCB1YMR296C 1677 nt11.62□□□□□ -0.55
UFE1P41834 YDR094WYDR094W 336 nt11.61□□□□□ -0.55
UFE1P41834 PAC11YDR488C 1602 nt11.59□□□□□ -0.55
UFE1P41834 PCM1YEL058W 1674 nt11.59□□□□□ -0.55
UFE1P41834 SNF6YHL025W 999 nt11.57□□□□□ -0.56
UFE1P41834 YNL195CYNL195C 786 nt11.57□□□□□ -0.56
UFE1P41834 NVJ2YPR091C 2313 nt11.54□□□□□ -0.56
UFE1P41834 DIC1YLR348C 897 nt11.54□□□□□ -0.56
UFE1P41834 TIM23YNR017W 669 nt11.52□□□□□ -0.57
UFE1P41834 YIH1YCR059C 777 nt11.48□□□□□ -0.57
UFE1P41834 RNQ1YCL028W 1218 nt11.48□□□□□ -0.57
UFE1P41834 RRT12YCR045C 1476 nt11.46□□□□□ -0.57
UFE1P41834 YSC84YHR016C 1407 nt11.44□□□□□ -0.58
UFE1P41834 YLR179CYLR179C 606 nt11.44□□□□□ -0.58
UFE1P41834 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.43□□□□□ -0.58
UFE1P41834 YHL050CYHL050C 2094 nt11.4□□□□□ -0.58
UFE1P41834 YPR064WYPR064W 420 nt11.4□□□□□ -0.58
UFE1P41834 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.36□□□□□ -0.59
UFE1P41834 BIO4YNR057C 714 nt11.35□□□□□ -0.59
UFE1P41834 WSC2YNL283C 1512 nt11.35□□□□□ -0.59
UFE1P41834 BDF1YLR399C 2061 nt11.34□□□□□ -0.59
UFE1P41834 AHT1YHR093W 549 nt11.34□□□□□ -0.59
UFE1P41834 SEC11YIR022W 504 nt11.34□□□□□ -0.59
UFE1P41834 YLL053CYLL053C 459 nt11.34□□□□□ -0.59
UFE1P41834 TAD3YLR316C 969 nt11.34□□□□□ -0.59
UFE1P41834 YFR018CYFR018C 1092 nt11.33□□□□□ -0.6
UFE1P41834 SIM1YIL123W 1431 nt11.33□□□□□ -0.6
UFE1P41834 AQY1YPR192W 918 nt11.32□□□□□ -0.6
UFE1P41834 FTR1YER145C 1215 nt11.29□□□□□ -0.6
UFE1P41834 GAL1YBR020W 1587 nt11.25□□□□□ -0.61
UFE1P41834 PAU16YKL224C 372 nt11.25□□□□□ -0.61
UFE1P41834 RRT5YFR032C 870 nt11.24□□□□□ -0.61
UFE1P41834 TAT1YBR069C 1860 nt11.23□□□□□ -0.61
UFE1P41834 TRM5YHR070W 1500 nt11.2□□□□□ -0.62
UFE1P41834 PRE6YOL038W 765 nt11.2□□□□□ -0.62
UFE1P41834 PCH2YBR186W 1695 nt11.18□□□□□ -0.62
UFE1P41834 ERF2YLR246W 1080 nt11.18□□□□□ -0.62
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