Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 YLR236CYLR236C 324 nt13.62□□□□□ -0.23
UBP11P36026 SPT5YML010W 3192 nt13.6□□□□□ -0.23
UBP11P36026 DSK2YMR276W 1122 nt13.59□□□□□ -0.23
UBP11P36026 SIS1YNL007C 1059 nt13.59□□□□□ -0.23
UBP11P36026 YJL152WYJL152W 360 nt13.57□□□□□ -0.24
UBP11P36026 MOT3YMR070W 1473 nt13.56□□□□□ -0.24
UBP11P36026 FMP45YDL222C 930 nt13.55□□□□□ -0.24
UBP11P36026 YCH1YGR203W 447 nt13.51□□□□□ -0.25
UBP11P36026 MEP2YNL142W 1500 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP11P36026 TIR4YOR009W 1464 nt13.49□□□□□ -0.25
UBP11P36026 PTP1YDL230W 1008 nt13.48□□□□□ -0.25
UBP11P36026 RPP2AYOL039W 321 nt13.48□□□□□ -0.25
UBP11P36026 IMP2'YIL154C 1041 nt13.46□□□□□ -0.25
UBP11P36026 ART5YGR068C 1761 nt13.41□□□□□ -0.26
UBP11P36026 DCW1YKL046C 1350 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP11P36026 LPX1YOR084W 1164 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP11P36026 CAC2YML102W 1407 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP11P36026 IDH1YNL037C 1083 nt13.34□□□□□ -0.27
UBP11P36026 YMR057CYMR057C 372 nt13.33□□□□□ -0.28
UBP11P36026 GFD2YCL036W 1701 nt13.32□□□□□ -0.28
UBP11P36026 ERV46YAL042W 1248 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP11P36026 PET9YBL030C 957 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP11P36026 SPP1YPL138C 1062 nt13.28□□□□□ -0.28
UBP11P36026 YDR433WYDR433W 441 nt13.27□□□□□ -0.29
UBP11P36026 GBP2YCL011C 1284 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP11P36026 MXR2YCL033C 507 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP11P36026 YKR040CYKR040C 504 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP11P36026 RTS2YOR077W 699 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP11P36026 EMI2YDR516C 1503 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP11P36026 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.16□□□□□ -0.3
UBP11P36026 IRC15YPL017C 1500 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP11P36026 FPS1YLL043W 2010 nt13.11□□□□□ -0.31
UBP11P36026 YDL221WYDL221W 552 nt13.07□□□□□ -0.32
UBP11P36026 DED1YOR204W 1815 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP11P36026 TCD2YKL027W 1344 nt13.03□□□□□ -0.32
UBP11P36026 RRD1YIL153W 1182 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP11P36026 RTG1YOL067C 534 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP11P36026 MRPL8YJL063C 717 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP11P36026 GIS3YLR094C 1509 nt13□□□□□ -0.33
UBP11P36026 CUE1YMR264W 612 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP11P36026 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP11P36026 YMR090WYMR090W 684 nt12.95□□□□□ -0.34
UBP11P36026 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP11P36026 YEL076CYEL076C 651 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP11P36026 YLR464WYLR464W 651 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP11P36026 FMT1YBL013W 1206 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP11P36026 FRD1YEL047C 1413 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP11P36026 SDH1YKL148C 1923 nt12.86□□□□□ -0.35
UBP11P36026 ADO1YJR105W 1023 nt12.86□□□□□ -0.35
UBP11P36026 YBR220CYBR220C 1683 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP11P36026 SCC4YER147C 1875 nt12.83□□□□□ -0.36
UBP11P36026 PTH1YHR189W 573 nt12.8□□□□□ -0.36
UBP11P36026 SOR2YDL246C 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP11P36026 YIL100WYIL100W 354 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP11P36026 SOR1YJR159W 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP11P36026 YCL042WYCL042W 360 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP11P36026 UBX6YJL048C 1191 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP11P36026 CWP1YKL096W 720 nt12.73□□□□□ -0.37
UBP11P36026 ADH2YMR303C 1047 nt12.72□□□□□ -0.37
UBP11P36026 FMP52YER004W 696 nt12.69□□□□□ -0.38
UBP11P36026 HUA1YGR268C 597 nt12.68□□□□□ -0.38
UBP11P36026 YKL030WYKL030W 606 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP11P36026 YLR235CYLR235C 399 nt12.62□□□□□ -0.39
UBP11P36026 LCB1YMR296C 1677 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP11P36026 PCM1YEL058W 1674 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP11P36026 RRT12YCR045C 1476 nt12.59□□□□□ -0.39
UBP11P36026 Q0182Q0182 405 nt12.55□□□□□ -0.4
UBP11P36026 SNF6YHL025W 999 nt12.53□□□□□ -0.4
UBP11P36026 YSC84YHR016C 1407 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP11P36026 DIC1YLR348C 897 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP11P36026 YNL195CYNL195C 786 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP11P36026 YDR094WYDR094W 336 nt12.49□□□□□ -0.41
UBP11P36026 YHL050CYHL050C 2094 nt12.48□□□□□ -0.41
UBP11P36026 TIM23YNR017W 669 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP11P36026 BDF1YLR399C 2061 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP11P36026 YIH1YCR059C 777 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP11P36026 RNQ1YCL028W 1218 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP11P36026 YLR179CYLR179C 606 nt12.4□□□□□ -0.42
UBP11P36026 YLL053CYLL053C 459 nt12.35□□□□□ -0.43
UBP11P36026 BIO4YNR057C 714 nt12.35□□□□□ -0.43
UBP11P36026 WSC2YNL283C 1512 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP11P36026 SIM1YIL123W 1431 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP11P36026 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.3□□□□□ -0.44
UBP11P36026 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.29□□□□□ -0.44
UBP11P36026 YPR064WYPR064W 420 nt12.28□□□□□ -0.44
UBP11P36026 AHT1YHR093W 549 nt12.27□□□□□ -0.45
UBP11P36026 TAT1YBR069C 1860 nt12.26□□□□□ -0.45
UBP11P36026 TAD3YLR316C 969 nt12.25□□□□□ -0.45
UBP11P36026 FTR1YER145C 1215 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP11P36026 SEC11YIR022W 504 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP11P36026 PRE6YOL038W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP11P36026 GAL1YBR020W 1587 nt12.22□□□□□ -0.45
UBP11P36026 YFR018CYFR018C 1092 nt12.21□□□□□ -0.45
UBP11P36026 TRM5YHR070W 1500 nt12.2□□□□□ -0.46
UBP11P36026 PAU16YKL224C 372 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP11P36026 PCH2YBR186W 1695 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP11P36026 PAC11YDR488C 1602 nt12.16□□□□□ -0.46
UBP11P36026 ATF2YGR177C 1608 nt12.15□□□□□ -0.46
UBP11P36026 YFL066CYFL066C 1179 nt12.14□□□□□ -0.47
UBP11P36026 AQY1YPR192W 918 nt12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 254.3 ms