Protein–RNA interactions for Protein: P32776

TFB1, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1, yeastyeast

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB1P32776 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
TFB1P32776 DSK2YMR276W 1122 nt12.22□□□□□ -0.45
TFB1P32776 IMP2'YIL154C 1041 nt12.21□□□□□ -0.45
TFB1P32776 TRM9YML014W 840 nt12.19□□□□□ -0.46
TFB1P32776 YBR220CYBR220C 1683 nt12.19□□□□□ -0.46
TFB1P32776 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.18□□□□□ -0.46
TFB1P32776 YCH1YGR203W 447 nt12.17□□□□□ -0.46
TFB1P32776 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
TFB1P32776 YDR095CYDR095C 411 nt12.14□□□□□ -0.47
TFB1P32776 YPR011CYPR011C 981 nt12.13□□□□□ -0.47
TFB1P32776 YLR236CYLR236C 324 nt12.11□□□□□ -0.47
TFB1P32776 YMR090WYMR090W 684 nt12.1□□□□□ -0.47
TFB1P32776 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.09□□□□□ -0.47
TFB1P32776 PAC11YDR488C 1602 nt12.08□□□□□ -0.48
TFB1P32776 ALF1YNL148C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
TFB1P32776 CCT6YDR188W 1641 nt12.06□□□□□ -0.48
TFB1P32776 ADO1YJR105W 1023 nt12.05□□□□□ -0.48
TFB1P32776 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
TFB1P32776 SDH1YKL148C 1923 nt12.01□□□□□ -0.49
TFB1P32776 CAC2YML102W 1407 nt11.96□□□□□ -0.49
TFB1P32776 PTP1YDL230W 1008 nt11.96□□□□□ -0.49
TFB1P32776 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.96□□□□□ -0.49
TFB1P32776 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.96□□□□□ -0.49
TFB1P32776 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.93□□□□□ -0.5
TFB1P32776 YEL076CYEL076C 651 nt11.93□□□□□ -0.5
TFB1P32776 YLR464WYLR464W 651 nt11.93□□□□□ -0.5
TFB1P32776 RPP2AYOL039W 321 nt11.91□□□□□ -0.5
TFB1P32776 SIS1YNL007C 1059 nt11.9□□□□□ -0.5
TFB1P32776 UBX6YJL048C 1191 nt11.89□□□□□ -0.51
TFB1P32776 LPX1YOR084W 1164 nt11.89□□□□□ -0.51
TFB1P32776 ERV46YAL042W 1248 nt11.88□□□□□ -0.51
TFB1P32776 PCH2YBR186W 1695 nt11.87□□□□□ -0.51
TFB1P32776 YJL152WYJL152W 360 nt11.87□□□□□ -0.51
TFB1P32776 GUT2YIL155C 1950 nt11.85□□□□□ -0.51
TFB1P32776 IDH1YNL037C 1083 nt11.84□□□□□ -0.51
TFB1P32776 SCC4YER147C 1875 nt11.83□□□□□ -0.52
TFB1P32776 FPS1YLL043W 2010 nt11.83□□□□□ -0.52
TFB1P32776 SEC11YIR022W 504 nt11.82□□□□□ -0.52
TFB1P32776 RTG1YOL067C 534 nt11.82□□□□□ -0.52
TFB1P32776 SPP1YPL138C 1062 nt11.82□□□□□ -0.52
TFB1P32776 IRC15YPL017C 1500 nt11.8□□□□□ -0.52
TFB1P32776 YDR433WYDR433W 441 nt11.77□□□□□ -0.53
TFB1P32776 YKR040CYKR040C 504 nt11.75□□□□□ -0.53
TFB1P32776 GIS3YLR094C 1509 nt11.72□□□□□ -0.53
TFB1P32776 NVJ2YPR091C 2313 nt11.72□□□□□ -0.53
TFB1P32776 ART5YGR068C 1761 nt11.72□□□□□ -0.53
TFB1P32776 PIB2YGL023C 1908 nt11.69□□□□□ -0.54
TFB1P32776 GFD2YCL036W 1701 nt11.68□□□□□ -0.54
TFB1P32776 TIR4YOR009W 1464 nt11.67□□□□□ -0.54
TFB1P32776 HUA1YGR268C 597 nt11.66□□□□□ -0.54
TFB1P32776 PET9YBL030C 957 nt11.65□□□□□ -0.54
TFB1P32776 GBP2YCL011C 1284 nt11.65□□□□□ -0.54
TFB1P32776 YSC84YHR016C 1407 nt11.62□□□□□ -0.55
TFB1P32776 YDR094WYDR094W 336 nt11.62□□□□□ -0.55
TFB1P32776 MXR2YCL033C 507 nt11.58□□□□□ -0.56
TFB1P32776 YHL050CYHL050C 2094 nt11.58□□□□□ -0.56
TFB1P32776 YMR057CYMR057C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB1P32776 RTS2YOR077W 699 nt11.55□□□□□ -0.56
TFB1P32776 RTF1YGL244W 1677 nt11.52□□□□□ -0.56
TFB1P32776 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.5□□□□□ -0.57
TFB1P32776 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.47□□□□□ -0.57
TFB1P32776 TCD2YKL027W 1344 nt11.46□□□□□ -0.57
TFB1P32776 RRT12YCR045C 1476 nt11.45□□□□□ -0.58
TFB1P32776 CUE1YMR264W 612 nt11.45□□□□□ -0.58
TFB1P32776 BOP3YNL042W 1191 nt11.41□□□□□ -0.58
TFB1P32776 PTK1YKL198C 1989 nt11.39□□□□□ -0.59
TFB1P32776 FRD1YEL047C 1413 nt11.35□□□□□ -0.59
TFB1P32776 YKL030WYKL030W 606 nt11.32□□□□□ -0.6
TFB1P32776 YNL195CYNL195C 786 nt11.32□□□□□ -0.6
TFB1P32776 YIL100WYIL100W 354 nt11.3□□□□□ -0.6
TFB1P32776 YLR235CYLR235C 399 nt11.3□□□□□ -0.6
TFB1P32776 PTH1YHR189W 573 nt11.29□□□□□ -0.6
TFB1P32776 YCL042WYCL042W 360 nt11.27□□□□□ -0.61
TFB1P32776 DED1YOR204W 1815 nt11.26□□□□□ -0.61
TFB1P32776 NCP1YHR042W 2076 nt11.26□□□□□ -0.61
TFB1P32776 RRD1YIL153W 1182 nt11.22□□□□□ -0.61
TFB1P32776 YJL225CYJL225C 5277 nt11.21□□□□□ -0.62
TFB1P32776 LCB1YMR296C 1677 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB1P32776 SOR2YDL246C 1074 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB1P32776 SOR1YJR159W 1074 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB1P32776 SBA1YKL117W 651 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB1P32776 PAU16YKL224C 372 nt11.15□□□□□ -0.62
TFB1P32776 YFR018CYFR018C 1092 nt11.12□□□□□ -0.63
TFB1P32776 RRT5YFR032C 870 nt11.12□□□□□ -0.63
TFB1P32776 FMT1YBL013W 1206 nt11.11□□□□□ -0.63
TFB1P32776 YFL054CYFL054C 1941 nt11.09□□□□□ -0.63
TFB1P32776 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.08□□□□□ -0.64
TFB1P32776 SPT8YLR055C 1809 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB1P32776 FMP52YER004W 696 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB1P32776 BOR1YNL275W 1731 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB1P32776 TIM23YNR017W 669 nt11.02□□□□□ -0.65
TFB1P32776 CWP1YKL096W 720 nt10.99□□□□□ -0.65
TFB1P32776 PRE6YOL038W 765 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB1P32776 PCM1YEL058W 1674 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB1P32776 DIC1YLR348C 897 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB1P32776 ADH2YMR303C 1047 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB1P32776 UME6YDR207C 2511 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB1P32776 YPR064WYPR064W 420 nt10.94□□□□□ -0.66
TFB1P32776 SNF6YHL025W 999 nt10.92□□□□□ -0.66
TFB1P32776 YLR179CYLR179C 606 nt10.92□□□□□ -0.66
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