Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 YPS1YLR120C 1710 nt12.4□□□□□ -0.43
BRF1P29056 WHI5YOR083W 888 nt12.39□□□□□ -0.43
BRF1P29056 PUS2YGL063W 1113 nt12.38□□□□□ -0.43
BRF1P29056 YDR095CYDR095C 411 nt12.35□□□□□ -0.43
BRF1P29056 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.35□□□□□ -0.43
BRF1P29056 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.35□□□□□ -0.43
BRF1P29056 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.3□□□□□ -0.44
BRF1P29056 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
BRF1P29056 MOT3YMR070W 1473 nt12.28□□□□□ -0.44
BRF1P29056 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.27□□□□□ -0.45
BRF1P29056 YMR090WYMR090W 684 nt12.21□□□□□ -0.45
BRF1P29056 SIS1YNL007C 1059 nt12.2□□□□□ -0.46
BRF1P29056 EMI2YDR516C 1503 nt12.17□□□□□ -0.46
BRF1P29056 UME6YDR207C 2511 nt12.16□□□□□ -0.46
BRF1P29056 DSK2YMR276W 1122 nt12.15□□□□□ -0.46
BRF1P29056 YJL152WYJL152W 360 nt12.14□□□□□ -0.47
BRF1P29056 YBR220CYBR220C 1683 nt12.13□□□□□ -0.47
BRF1P29056 IMP2'YIL154C 1041 nt12.12□□□□□ -0.47
BRF1P29056 RPP2AYOL039W 321 nt12.12□□□□□ -0.47
BRF1P29056 YPR011CYPR011C 981 nt12.11□□□□□ -0.47
BRF1P29056 YLR236CYLR236C 324 nt12.1□□□□□ -0.47
BRF1P29056 FMP45YDL222C 930 nt12.07□□□□□ -0.48
BRF1P29056 YDL221WYDL221W 552 nt12.05□□□□□ -0.48
BRF1P29056 PTP1YDL230W 1008 nt12.05□□□□□ -0.48
BRF1P29056 TIR4YOR009W 1464 nt12.05□□□□□ -0.48
BRF1P29056 YCH1YGR203W 447 nt12.04□□□□□ -0.48
BRF1P29056 ART5YGR068C 1761 nt12□□□□□ -0.49
BRF1P29056 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
BRF1P29056 IDH1YNL037C 1083 nt11.97□□□□□ -0.49
BRF1P29056 CAC2YML102W 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
BRF1P29056 PET9YBL030C 957 nt11.94□□□□□ -0.5
BRF1P29056 GFD2YCL036W 1701 nt11.92□□□□□ -0.5
BRF1P29056 YMR057CYMR057C 372 nt11.91□□□□□ -0.5
BRF1P29056 LPX1YOR084W 1164 nt11.89□□□□□ -0.51
BRF1P29056 MRPL8YJL063C 717 nt11.88□□□□□ -0.51
BRF1P29056 ERV46YAL042W 1248 nt11.87□□□□□ -0.51
BRF1P29056 YJL225CYJL225C 5277 nt11.86□□□□□ -0.51
BRF1P29056 GBP2YCL011C 1284 nt11.86□□□□□ -0.51
BRF1P29056 YDR433WYDR433W 441 nt11.85□□□□□ -0.51
BRF1P29056 SCC4YER147C 1875 nt11.85□□□□□ -0.51
BRF1P29056 SEC11YIR022W 504 nt11.84□□□□□ -0.51
BRF1P29056 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.84□□□□□ -0.51
BRF1P29056 PCH2YBR186W 1695 nt11.81□□□□□ -0.52
BRF1P29056 IRC15YPL017C 1500 nt11.79□□□□□ -0.52
BRF1P29056 YKR040CYKR040C 504 nt11.77□□□□□ -0.53
BRF1P29056 RTS2YOR077W 699 nt11.77□□□□□ -0.53
BRF1P29056 GUT2YIL155C 1950 nt11.75□□□□□ -0.53
BRF1P29056 MXR2YCL033C 507 nt11.74□□□□□ -0.53
BRF1P29056 GIS3YLR094C 1509 nt11.73□□□□□ -0.53
BRF1P29056 RPM1RPM1 483 nt11.72□□□□□ -0.53
BRF1P29056 SPP1YPL138C 1062 nt11.72□□□□□ -0.53
BRF1P29056 ADO1YJR105W 1023 nt11.7□□□□□ -0.54
BRF1P29056 TCD2YKL027W 1344 nt11.69□□□□□ -0.54
BRF1P29056 CUE1YMR264W 612 nt11.66□□□□□ -0.54
BRF1P29056 RRD1YIL153W 1182 nt11.62□□□□□ -0.55
BRF1P29056 DED1YOR204W 1815 nt11.61□□□□□ -0.55
BRF1P29056 YSC84YHR016C 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
BRF1P29056 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.57□□□□□ -0.56
BRF1P29056 YEL076CYEL076C 651 nt11.57□□□□□ -0.56
BRF1P29056 YLR464WYLR464W 651 nt11.57□□□□□ -0.56
BRF1P29056 BOR1YNL275W 1731 nt11.57□□□□□ -0.56
BRF1P29056 RTG1YOL067C 534 nt11.54□□□□□ -0.56
BRF1P29056 MCH5YOR306C 1566 nt11.53□□□□□ -0.56
BRF1P29056 FRD1YEL047C 1413 nt11.52□□□□□ -0.56
BRF1P29056 YIL100WYIL100W 354 nt11.52□□□□□ -0.57
BRF1P29056 YHL050CYHL050C 2094 nt11.51□□□□□ -0.57
BRF1P29056 PIB2YGL023C 1908 nt11.51□□□□□ -0.57
BRF1P29056 FMT1YBL013W 1206 nt11.5□□□□□ -0.57
BRF1P29056 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.49□□□□□ -0.57
BRF1P29056 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.49□□□□□ -0.57
BRF1P29056 RTF1YGL244W 1677 nt11.49□□□□□ -0.57
BRF1P29056 YNL195CYNL195C 786 nt11.47□□□□□ -0.57
BRF1P29056 YCL042WYCL042W 360 nt11.47□□□□□ -0.57
BRF1P29056 UBX6YJL048C 1191 nt11.46□□□□□ -0.57
BRF1P29056 SOR2YDL246C 1074 nt11.45□□□□□ -0.58
BRF1P29056 SOR1YJR159W 1074 nt11.45□□□□□ -0.58
BRF1P29056 FMP52YER004W 696 nt11.43□□□□□ -0.58
BRF1P29056 BOP3YNL042W 1191 nt11.42□□□□□ -0.58
BRF1P29056 RRT12YCR045C 1476 nt11.42□□□□□ -0.58
BRF1P29056 PTH1YHR189W 573 nt11.38□□□□□ -0.59
BRF1P29056 CWP1YKL096W 720 nt11.37□□□□□ -0.59
BRF1P29056 HUA1YGR268C 597 nt11.34□□□□□ -0.59
BRF1P29056 ADH2YMR303C 1047 nt11.34□□□□□ -0.59
BRF1P29056 YLR235CYLR235C 399 nt11.33□□□□□ -0.6
BRF1P29056 YKL030WYKL030W 606 nt11.29□□□□□ -0.6
BRF1P29056 PCM1YEL058W 1674 nt11.28□□□□□ -0.6
BRF1P29056 PTK1YKL198C 1989 nt11.27□□□□□ -0.61
BRF1P29056 YDR094WYDR094W 336 nt11.26□□□□□ -0.61
BRF1P29056 SNF6YHL025W 999 nt11.25□□□□□ -0.61
BRF1P29056 LCB1YMR296C 1677 nt11.24□□□□□ -0.61
BRF1P29056 DIC1YLR348C 897 nt11.19□□□□□ -0.62
BRF1P29056 NCP1YHR042W 2076 nt11.17□□□□□ -0.62
BRF1P29056 TIM23YNR017W 669 nt11.16□□□□□ -0.62
BRF1P29056 ALG12YNR030W 1656 nt11.14□□□□□ -0.63
BRF1P29056 YIH1YCR059C 777 nt11.14□□□□□ -0.63
BRF1P29056 RNQ1YCL028W 1218 nt11.14□□□□□ -0.63
BRF1P29056 FRE6YLL051C 2139 nt11.14□□□□□ -0.63
BRF1P29056 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.11□□□□□ -0.63
BRF1P29056 YLR179CYLR179C 606 nt11.09□□□□□ -0.63
BRF1P29056 YFL054CYFL054C 1941 nt11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms