Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 312.83□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 108.2
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DDX6P26196 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 105.5
DDX6P26196 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 105.5
DDX6P26196 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 416.63■□□□□ 0.251e-12■■■■■ 103.9
DDX6P26196 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 216.55■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 100.1
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DDX6P26196 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 100.1
DDX6P26196 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 100.1
DDX6P26196 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 100.1
DDX6P26196 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 39.04□□□□□ -0.966e-8■■■■■ 100.1
DDX6P26196 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 55.91□□□□□ -1.466e-8■■■■■ 100.1
DDX6P26196 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 39.91□□□□□ -0.828e-13■■■■■ 99.9
DDX6P26196 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.118e-13■■■■■ 99.9
DDX6P26196 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.178e-13■■■■■ 99.9
DDX6P26196 MAP4-216ENST00000633710 570 ntTSL 55.84□□□□□ -1.478e-13■■■■■ 99.9
DDX6P26196 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.193e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-217ENST00000583683 1802 ntTSL 218.77■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-204ENST00000578172 3927 nt12.73□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 43.65□□□□□ -1.833e-8■■■■■ 98.7
DDX6P26196 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 316.86■□□□□ 0.297e-24■■■■■ 97.4
DDX6P26196 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-22■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 413.08□□□□□ -0.323e-22■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 94.4
DDX6P26196 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 524.59■■□□□ 1.535e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.535e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 318.23■□□□□ 0.515e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 215.98■□□□□ 0.155e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 27.43□□□□□ -1.225e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.755e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 53.98□□□□□ -1.775e-18■■■■■ 93.3
DDX6P26196 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.34□□□□□ -2.044e-22■■■■■ 93.3
DDX6P26196 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.062e-11■■■■■ 93.3
DDX6P26196 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.575e-12■■■■■ 93.3
DDX6P26196 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-12■■■■■ 93.3
DDX6P26196 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-11■■■■■ 93.3
DDX6P26196 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-11■■■■■ 93.3
DDX6P26196 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-11■■■■■ 93.3
DDX6P26196 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 321.65■■□□□ 1.061e-23■■■■■ 92.1
DDX6P26196 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-23■■■■■ 92.1
DDX6P26196 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-23■■■■■ 92.1
DDX6P26196 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-23■■■■■ 92.1
DDX6P26196 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-23■■■■■ 92.1
DDX6P26196 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 91.9
DDX6P26196 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 91.9
DDX6P26196 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 332.38■■■□□ 2.774e-10■■■■■ 91.8
DDX6P26196 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 314.57□□□□□ -0.084e-10■■■■■ 91.8
DDX6P26196 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-18■■■■■ 89.2
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DDX6P26196 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 214.2□□□□□ -0.145e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.165e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.395e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.945e-18■■■■■ 89.2
DDX6P26196 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.487e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.43□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.86□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 88.3
DDX6P26196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.253e-7■■■■■ 87
DDX6P26196 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 87
DDX6P26196 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 87
DDX6P26196 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 87
DDX6P26196 GLMP-208ENST00000481050 684 ntTSL 319.27■□□□□ 0.684e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-202ENST00000422879 1392 ntTSL 217.86■□□□□ 0.454e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-203ENST00000461597 658 ntTSL 316.97■□□□□ 0.314e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.154e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-204ENST00000472870 1188 ntTSL 515.16■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 GLMP-209ENST00000482579 572 ntTSL 312.8□□□□□ -0.364e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-203ENST00000559537 539 ntTSL 411.11□□□□□ -0.634e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-207ENST00000619987 3978 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-204ENST00000560189 936 ntTSL 510.57□□□□□ -0.724e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 MESD-205ENST00000560244 981 ntTSL 510.02□□□□□ -0.814e-11■■■■■ 86.6
DDX6P26196 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 86.6
DDX6P26196 SYN3-207ENST00000462268 488 ntTSL 39.43□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 86.6
DDX6P26196 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 324.07■■□□□ 1.446e-8■■■■■ 85.5
DDX6P26196 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 81.5
DDX6P26196 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 81.5
DDX6P26196 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 81.5
DDX6P26196 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 81.5
DDX6P26196 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 518.23■□□□□ 0.515e-10■■■■■ 80.9
DDX6P26196 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 518.01■□□□□ 0.475e-10■■■■■ 80.9
DDX6P26196 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 517.62■□□□□ 0.415e-10■■■■■ 80.9
DDX6P26196 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-10■■■■■ 80.9
DDX6P26196 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-10■■■■■ 80.9
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