Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 LRWD1-207ENST00000485417 552 ntTSL 519.08■□□□□ 0.653e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 MZT2A-203ENST00000427024 679 ntTSL 318.88■□□□□ 0.613e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 LRWD1-208ENST00000485808 908 ntTSL 518.67■□□□□ 0.583e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-23■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 CAPZB-209ENST00000489607 488 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-23■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 LRWD1-205ENST00000473880 5491 ntTSL 215.39■□□□□ 0.063e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ANKRD13B-202ENST00000487527 3023 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.023e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 CAPZB-206ENST00000457768 432 ntTSL 313.52□□□□□ -0.251e-23■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 MYO3B-206ENST00000442690 1720 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.383e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.533e-18■■■■■ 413.6
SF3B1O75533 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 405.8
SF3B1O75533 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 405.8
SF3B1O75533 MIB2-215ENST00000502470 780 ntTSL 529.71■■■□□ 2.351e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 MIB2-221ENST00000507082 1578 ntTSL 226.68■■□□□ 1.861e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 421.79■■□□□ 1.081e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 MIB2-204ENST00000463492 486 ntTSL 221.62■■□□□ 1.051e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DDI2-205ENST00000546927 592 ntTSL 221.54■■□□□ 1.041e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 419.63■□□□□ 0.731e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 319.14■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ASB13-203ENST00000479033 2565 ntTSL 219.13■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 318.56■□□□□ 0.561e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 GNPDA1-206ENST00000504424 473 ntTSL 418.19■□□□□ 0.51e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.431e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.341e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-222ENST00000636280 2462 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DDI2-204ENST00000486680 1501 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.211e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.211e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.121e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 MIB2-209ENST00000477990 2821 ntTSL 214.21□□□□□ -0.141e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.141e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-207ENST00000505689 925 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-208ENST00000559153 1918 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.271e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-203ENST00000503229 543 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 AL031847.1-201ENST00000455744 378 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-202ENST00000500692 2319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.521e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ST3GAL1-210ENST00000522285 393 ntTSL 311.46□□□□□ -0.571e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 IQCH-AS1-202ENST00000559285 928 ntTSL 211.45□□□□□ -0.581e-16■■■■■ 379.1
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SF3B1O75533 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-209ENST00000559291 6131 ntTSL 510.33□□□□□ -0.761e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 RDH16-201ENST00000360752 3198 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.821e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-205ENST00000504139 754 ntTSL 59.83□□□□□ -0.841e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.951e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 GNPDA1-208ENST00000507107 556 ntTSL 29.11□□□□□ -0.951e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.971e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.051e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.051e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-224ENST00000636874 126 ntTSL 57.03□□□□□ -1.281e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 DNM1-219ENST00000636103 128 ntTSL 54.99□□□□□ -1.611e-16■■■■■ 379.1
SF3B1O75533 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-21■■■■■ 370.5
SF3B1O75533 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.511e-20■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-201ENST00000338427 779 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-206ENST00000475952 983 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-210ENST00000493613 613 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 39.03□□□□□ -0.962e-15■■■■■ 361.9
SF3B1O75533 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 226.06■■□□□ 1.762e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 324.35■■□□□ 1.492e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 422.95■■□□□ 1.262e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-18■■■■■ 347.6
SF3B1O75533 TP53INP2-204ENST00000451665 477 ntTSL 522.74■■□□□ 1.238e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-203ENST00000414082 442 ntTSL 317.17■□□□□ 0.348e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.38e-12■■■■■ 347
SF3B1O75533 PACSIN2-211ENST00000507586 362 ntTSL 36.85□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 346.4
SF3B1O75533 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 FBF1-211ENST00000593076 854 ntTSL 521.62■■□□□ 1.053e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SHISA7-202ENST00000416792 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.13■□□□□ 0.973e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 220.67■□□□□ 0.93e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.823e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SCAPER-214ENST00000565372 572 ntTSL 419.87■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 SCAPER-211ENST00000564177 576 ntTSL 419.87■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
SF3B1O75533 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-15■■■■■ 344.6
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