Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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