Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms