Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms