Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXD3Q9UJU5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms