Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms