Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms