Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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