Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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BPESC1Q9GZL8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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BPESC1Q9GZL8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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BPESC1Q9GZL8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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