Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms