Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms