Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms