Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms