Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms