Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THUMPD3Q9BV44 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms