Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms