Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms