Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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