Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms