Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP9Q99956 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms