Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms