Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms