Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms