Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1362.4 ms