Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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