Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms