Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms