Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP13Q92995 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP13Q92995 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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